Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM9

Uck2, Uridine-cytidine kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uck2Q99PM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Uck2Q99PM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Uck2Q99PM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Uck2Q99PM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Uck2Q99PM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Uck2Q99PM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Uck2Q99PM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Uck2Q99PM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Uck2Q99PM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Uck2Q99PM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Uck2Q99PM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uck2Q99PM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Uck2Q99PM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Uck2Q99PM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Uck2Q99PM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Uck2Q99PM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Uck2Q99PM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Uck2Q99PM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Uck2Q99PM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uck2Q99PM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uck2Q99PM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Uck2Q99PM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uck2Q99PM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uck2Q99PM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uck2Q99PM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uck2Q99PM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uck2Q99PM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Uck2Q99PM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Uck2Q99PM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Uck2Q99PM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uck2Q99PM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uck2Q99PM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uck2Q99PM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Uck2Q99PM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uck2Q99PM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uck2Q99PM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uck2Q99PM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Uck2Q99PM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Uck2Q99PM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Uck2Q99PM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uck2Q99PM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Uck2Q99PM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Uck2Q99PM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Uck2Q99PM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Uck2Q99PM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Uck2Q99PM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Uck2Q99PM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Uck2Q99PM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uck2Q99PM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Uck2Q99PM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Uck2Q99PM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Uck2Q99PM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Uck2Q99PM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Uck2Q99PM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Uck2Q99PM9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Uck2Q99PM9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uck2Q99PM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Uck2Q99PM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Uck2Q99PM9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Uck2Q99PM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Uck2Q99PM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Uck2Q99PM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Uck2Q99PM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Uck2Q99PM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Uck2Q99PM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uck2Q99PM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uck2Q99PM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uck2Q99PM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uck2Q99PM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uck2Q99PM9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Uck2Q99PM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Uck2Q99PM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Uck2Q99PM9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Uck2Q99PM9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Uck2Q99PM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Uck2Q99PM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Uck2Q99PM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Uck2Q99PM9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Uck2Q99PM9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Uck2Q99PM9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Uck2Q99PM9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Uck2Q99PM9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uck2Q99PM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uck2Q99PM9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uck2Q99PM9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uck2Q99PM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uck2Q99PM9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uck2Q99PM9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uck2Q99PM9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uck2Q99PM9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uck2Q99PM9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uck2Q99PM9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uck2Q99PM9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uck2Q99PM9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uck2Q99PM9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uck2Q99PM9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uck2Q99PM9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uck2Q99PM9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uck2Q99PM9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uck2Q99PM9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.8 ms