Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL51

Gsk3a, Glycogen synthase kinase-3 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsk3aQ2NL51 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,61■■■■□ 3,13
Gsk3aQ2NL51 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Gsk3aQ2NL51 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gsk3aQ2NL51 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Gsk3aQ2NL51 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Gsk3aQ2NL51 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,4■■■□□ 2,62
Gsk3aQ2NL51 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,76■■■□□ 2,51
Gsk3aQ2NL51 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Gsk3aQ2NL51 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Gsk3aQ2NL51 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Gsk3aQ2NL51 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,75■■■□□ 2,35
Gsk3aQ2NL51 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Gsk3aQ2NL51 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Gsk3aQ2NL51 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Gsk3aQ2NL51 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Gsk3aQ2NL51 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Gsk3aQ2NL51 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Gsk3aQ2NL51 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Gsk3aQ2NL51 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Gsk3aQ2NL51 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Gsk3aQ2NL51 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Gsk3aQ2NL51 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gsk3aQ2NL51 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Gsk3aQ2NL51 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Gsk3aQ2NL51 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gsk3aQ2NL51 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Gsk3aQ2NL51 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gsk3aQ2NL51 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Gsk3aQ2NL51 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Gsk3aQ2NL51 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Gsk3aQ2NL51 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Gsk3aQ2NL51 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Gsk3aQ2NL51 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Gsk3aQ2NL51 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gsk3aQ2NL51 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Gsk3aQ2NL51 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Gsk3aQ2NL51 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Gsk3aQ2NL51 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Gsk3aQ2NL51 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Gsk3aQ2NL51 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Gsk3aQ2NL51 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Gsk3aQ2NL51 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Gsk3aQ2NL51 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Gsk3aQ2NL51 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Gsk3aQ2NL51 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Gsk3aQ2NL51 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gsk3aQ2NL51 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gsk3aQ2NL51 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Gsk3aQ2NL51 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,56■■■□□ 2
Gsk3aQ2NL51 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Gsk3aQ2NL51 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Gsk3aQ2NL51 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Gsk3aQ2NL51 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Gsk3aQ2NL51 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Gsk3aQ2NL51 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Gsk3aQ2NL51 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Gsk3aQ2NL51 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Gsk3aQ2NL51 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Gsk3aQ2NL51 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Gsk3aQ2NL51 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Gsk3aQ2NL51 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Gsk3aQ2NL51 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
Gsk3aQ2NL51 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gsk3aQ2NL51 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Gsk3aQ2NL51 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gsk3aQ2NL51 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gsk3aQ2NL51 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gsk3aQ2NL51 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Gsk3aQ2NL51 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Gsk3aQ2NL51 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Gsk3aQ2NL51 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gsk3aQ2NL51 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Gsk3aQ2NL51 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Gsk3aQ2NL51 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Gsk3aQ2NL51 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Gsk3aQ2NL51 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Gsk3aQ2NL51 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Gsk3aQ2NL51 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Gsk3aQ2NL51 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Gsk3aQ2NL51 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Gsk3aQ2NL51 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Gsk3aQ2NL51 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Gsk3aQ2NL51 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Gsk3aQ2NL51 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Gsk3aQ2NL51 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gsk3aQ2NL51 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gsk3aQ2NL51 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gsk3aQ2NL51 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Gsk3aQ2NL51 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Gsk3aQ2NL51 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Gsk3aQ2NL51 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Gsk3aQ2NL51 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Gsk3aQ2NL51 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Gsk3aQ2NL51 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Gsk3aQ2NL51 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gsk3aQ2NL51 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Gsk3aQ2NL51 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Gsk3aQ2NL51 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Gsk3aQ2NL51 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Gsk3aQ2NL51 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms