Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Stfa3P35173 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stfa3P35173 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Stfa3P35173 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Stfa3P35173 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Stfa3P35173 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Stfa3P35173 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Stfa3P35173 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Stfa3P35173 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Stfa3P35173 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Stfa3P35173 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Stfa3P35173 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Stfa3P35173 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Stfa3P35173 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stfa3P35173 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Stfa3P35173 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Stfa3P35173 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Stfa3P35173 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Stfa3P35173 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Stfa3P35173 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Stfa3P35173 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Stfa3P35173 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Stfa3P35173 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Stfa3P35173 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Stfa3P35173 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Stfa3P35173 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Stfa3P35173 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Stfa3P35173 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Stfa3P35173 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,12■■□□□ 1,77
Stfa3P35173 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Stfa3P35173 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Stfa3P35173 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Stfa3P35173 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Stfa3P35173 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Stfa3P35173 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,77■■□□□ 1,72
Stfa3P35173 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Stfa3P35173 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Stfa3P35173 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Stfa3P35173 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Stfa3P35173 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Stfa3P35173 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
Stfa3P35173 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Stfa3P35173 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Stfa3P35173 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Stfa3P35173 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Stfa3P35173 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Stfa3P35173 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Stfa3P35173 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Stfa3P35173 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Stfa3P35173 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Stfa3P35173 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Stfa3P35173 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Stfa3P35173 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Stfa3P35173 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Stfa3P35173 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Stfa3P35173 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Stfa3P35173 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Stfa3P35173 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Stfa3P35173 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Stfa3P35173 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,59
Stfa3P35173 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Stfa3P35173 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Stfa3P35173 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
Stfa3P35173 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Stfa3P35173 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Stfa3P35173 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Stfa3P35173 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Stfa3P35173 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Stfa3P35173 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Stfa3P35173 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Stfa3P35173 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Stfa3P35173 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Stfa3P35173 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Stfa3P35173 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Stfa3P35173 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Stfa3P35173 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Stfa3P35173 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Stfa3P35173 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Stfa3P35173 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Stfa3P35173 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,59■■□□□ 1,53
Stfa3P35173 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Stfa3P35173 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Stfa3P35173 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Stfa3P35173 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Stfa3P35173 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Stfa3P35173 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Stfa3P35173 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Stfa3P35173 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Stfa3P35173 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Stfa3P35173 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Stfa3P35173 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Stfa3P35173 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Stfa3P35173 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
Stfa3P35173 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms