Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Stfa3P35173 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stfa3P35173 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Stfa3P35173 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Stfa3P35173 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Stfa3P35173 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Stfa3P35173 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Stfa3P35173 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stfa3P35173 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stfa3P35173 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Stfa3P35173 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stfa3P35173 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stfa3P35173 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stfa3P35173 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stfa3P35173 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Stfa3P35173 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Stfa3P35173 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stfa3P35173 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stfa3P35173 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stfa3P35173 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Stfa3P35173 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stfa3P35173 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stfa3P35173 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stfa3P35173 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Stfa3P35173 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stfa3P35173 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stfa3P35173 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stfa3P35173 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stfa3P35173 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Stfa3P35173 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stfa3P35173 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stfa3P35173 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stfa3P35173 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stfa3P35173 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stfa3P35173 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stfa3P35173 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stfa3P35173 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Stfa3P35173 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Stfa3P35173 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stfa3P35173 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stfa3P35173 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Stfa3P35173 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stfa3P35173 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stfa3P35173 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stfa3P35173 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stfa3P35173 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Stfa3P35173 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stfa3P35173 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stfa3P35173 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stfa3P35173 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stfa3P35173 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stfa3P35173 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stfa3P35173 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stfa3P35173 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stfa3P35173 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stfa3P35173 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stfa3P35173 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stfa3P35173 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Stfa3P35173 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stfa3P35173 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stfa3P35173 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stfa3P35173 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stfa3P35173 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Stfa3P35173 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stfa3P35173 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stfa3P35173 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stfa3P35173 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Stfa3P35173 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Stfa3P35173 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stfa3P35173 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Stfa3P35173 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Stfa3P35173 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stfa3P35173 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Stfa3P35173 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Stfa3P35173 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Stfa3P35173 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stfa3P35173 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stfa3P35173 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stfa3P35173 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stfa3P35173 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Stfa3P35173 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Stfa3P35173 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Stfa3P35173 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stfa3P35173 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stfa3P35173 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stfa3P35173 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Stfa3P35173 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stfa3P35173 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Stfa3P35173 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stfa3P35173 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stfa3P35173 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stfa3P35173 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stfa3P35173 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Stfa3P35173 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms