Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Snx6Q6P8X1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Snx6Q6P8X1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Snx6Q6P8X1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Snx6Q6P8X1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Snx6Q6P8X1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Snx6Q6P8X1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Snx6Q6P8X1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Snx6Q6P8X1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Snx6Q6P8X1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Snx6Q6P8X1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Snx6Q6P8X1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Snx6Q6P8X1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Snx6Q6P8X1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Snx6Q6P8X1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Snx6Q6P8X1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Snx6Q6P8X1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Snx6Q6P8X1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snx6Q6P8X1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snx6Q6P8X1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snx6Q6P8X1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snx6Q6P8X1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snx6Q6P8X1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snx6Q6P8X1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Snx6Q6P8X1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx6Q6P8X1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx6Q6P8X1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Snx6Q6P8X1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snx6Q6P8X1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx6Q6P8X1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx6Q6P8X1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Snx6Q6P8X1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx6Q6P8X1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx6Q6P8X1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx6Q6P8X1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snx6Q6P8X1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx6Q6P8X1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx6Q6P8X1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx6Q6P8X1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx6Q6P8X1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx6Q6P8X1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx6Q6P8X1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx6Q6P8X1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Snx6Q6P8X1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snx6Q6P8X1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Snx6Q6P8X1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snx6Q6P8X1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snx6Q6P8X1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snx6Q6P8X1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snx6Q6P8X1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snx6Q6P8X1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Snx6Q6P8X1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Snx6Q6P8X1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Snx6Q6P8X1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snx6Q6P8X1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Snx6Q6P8X1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Snx6Q6P8X1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snx6Q6P8X1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx6Q6P8X1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx6Q6P8X1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snx6Q6P8X1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snx6Q6P8X1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx6Q6P8X1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snx6Q6P8X1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snx6Q6P8X1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx6Q6P8X1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Snx6Q6P8X1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Snx6Q6P8X1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Snx6Q6P8X1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snx6Q6P8X1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx6Q6P8X1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx6Q6P8X1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx6Q6P8X1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx6Q6P8X1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx6Q6P8X1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx6Q6P8X1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx6Q6P8X1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx6Q6P8X1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snx6Q6P8X1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snx6Q6P8X1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snx6Q6P8X1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snx6Q6P8X1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snx6Q6P8X1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snx6Q6P8X1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snx6Q6P8X1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snx6Q6P8X1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snx6Q6P8X1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snx6Q6P8X1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snx6Q6P8X1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Snx6Q6P8X1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Snx6Q6P8X1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx6Q6P8X1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Snx6Q6P8X1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Snx6Q6P8X1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Snx6Q6P8X1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Snx6Q6P8X1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx6Q6P8X1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Snx6Q6P8X1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Snx6Q6P8X1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Snx6Q6P8X1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.6 ms