RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)K

tK(UUU)K, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeast

Gene tK(UUU)K, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RGP1	P16664	663 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	BIO2	P32451	375 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	TMT1	P32643	299 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SIP3	P38717	1229 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YHR202W	P38887	602 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	FMP10	P40098	244 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	OPT1	P40897	799 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	BFA1	P47113	574 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CTR1	P49573	406 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	UBA2	P52488	636 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RTT102	P53330	157 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	IES4	Q08561	116 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	MYO1	P08964	1928 aa		3.62	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YMR084W	A2P2R3	262 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	PET10	P36139	283 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.61	□□□□□ -1.83	not detected
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YGL081W	P53156	320 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	VPS20	Q04272	221 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YML083C	Q04526	418 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	COG8	Q04632	607 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ESC8	Q08119	714 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	DAP1	Q12091	152 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	TFC8	Q12308	588 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	VPS13	Q07878	3144 aa		3.61	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	HAP2	P06774	265 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RDS1	P25611	832 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	COQ8	P27697	501 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RAD54	P32863	898 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	MNR2	P35724	969 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	MMS4	P38257	691 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	UBX7	P38349	436 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	PIH1	P38768	344 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YHR131C	P38835	850 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	GUP1	P53154	560 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CUL3	P53202	744 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YNL146W	P53906	100 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	VTC3	Q02725	835 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YDR090C	Q03193	310 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RAD59	Q12223	238 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	PTC5	Q12511	572 aa		3.6	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	not detected
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	PHO8	P11491	566 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	GLN3	P18494	730 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	VPS3	P23643	1011 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.59	□□□□□ -1.83	not detected
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ADK2	P26364	225 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	HIR1	P32479	840 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YSC83	P32792	385 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ELM1	P32801	640 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CSE2	P33308	149 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	KDX1	P36005	433 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	MNN4	P36044	1178 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	CTM1	P38818	585 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	XDJ1	P39102	459 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YEL076C	P39971	216 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YEL023C	P39992	682 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	RSM25	P40496	264 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	HUL4	P40985	892 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	BRE2	P43132	505 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	COS5	P47187	383 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YGR153W	P48238	217 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	TOF1	P53840	1238 aa		3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
tK(UUU)K	tK(UUU)K	YNL034W	P53963	612 aa		3.59	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.2 ms