RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A NOT3P06102 836 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ERG11P10614 530 aa1.09□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A ASF1P32447 279 aa1.09□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A STB4P50104 949 aa1.09□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A GDE1Q02979 1223 aa1.09□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YPL060C-AYPL060C-A STE12P13574 688 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A LYP1P32487 611 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A KTR4P38131 464 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A PEA2P40091 420 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RAI1P53063 387 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A THI7Q05998 598 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YOR389WQ08912 624 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TIP41Q12199 356 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RPS9BP05755 195 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ABF1P14164 731 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A LNP1P38878 278 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A NOP12Q08208 459 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YOL073CQ08232 322 aa1.09□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A BI4P03879 638 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MDM10P18409 493 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RAD53P22216 821 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A KCC4P25389 1037 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ORC4P54791 529 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A GNT1Q12096 491 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TSR4P25040 408 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A EXO5P38289 585 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A IRC10Q08118 586 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A CRT10Q08226 957 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MDM20Q12387 796 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YOR131CQ12486 218 aa1.08□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A HIS5P07172 385 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YER152CP10356 443 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ARG2P40360 574 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ORC3P54790 616 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A FRE5Q08908 694 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RTT10Q08924 1013 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MOH1P38191 138 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YIL166CP40445 542 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A GAD1Q04792 585 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A CYB2P00175 591 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A PRP9P19736 530 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A UGA4P32837 571 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A GEM1P39722 662 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MND2P40577 368 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A HSV2P50079 448 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RSC4Q02206 625 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TDA5Q06417 326 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TGL5Q12043 749 aa1.07□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MSS4P38994 779 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RPN3P40016 523 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A GAT1P43574 510 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MUP1P50276 574 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RIA1P53893 1110 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A DBP5P20449 482 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RIM11P38615 370 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RPN10P38886 268 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ALY2P47029 1046 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YGL140CP53120 1219 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YDR514CQ04408 483 aa1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A THI80P35202 319 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YHL017WP38745 532 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A SAK1P38990 1142 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A STP1Q00947 519 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A SAM35P14693 329 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TMT1P32643 299 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A DOM34P33309 386 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YJL206CP39529 758 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A HUL4P40985 892 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ALR2P43553 858 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A IMO32P53219 342 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A SPO75Q07798 868 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A DIF1O13577 133 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data1.05□□□□□ -2.24not detected
YPL060C-AYPL060C-A PPS1P38148 807 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A IRC3Q06683 689 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RKM4Q12504 494 aa1.05□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TAF13P11747 167 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ATG19P35193 415 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YJL043WP47053 257 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A APC11Q12157 165 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YOR022CQ12204 715 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ICT1Q12385 394 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ABD1P32783 436 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A TSA1P34760 196 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A GLG1P36143 616 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A FAA3P39002 694 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YIL092WP40497 633 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A HFM1P51979 1187 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A CTK1Q03957 528 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YPR071WQ12346 211 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A RAD2P07276 1031 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A ILV6P25605 309 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YBR284WP38150 797 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A YPL071CQ02864 156 aa1.04□□□□□ -2.24
YPL060C-AYPL060C-A PLB2Q03674 706 aa1.04□□□□□ -2.24
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