RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRD1	YOL013C	ERP2	P39704	215 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	MXR1	P40029	184 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YJR120W	P47157	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YGR053C	P53234	283 aa		4.14	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	UGA2	P38067	497 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PNT1	P38969	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	TOD6	P34219	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YKL107W	P34251	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PAF1	P38351	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	MEF2	P39677	819 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YGL176C	P46945	554 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
HRD1	YOL013C	ESC8	Q08119	714 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	NTG2	Q08214	380 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	TMA17	Q12513	150 aa		4.13	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	MRC1	P25588	1096 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	APL1	P27351	700 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YBR184W	P38299	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	RRT14	P40470	206 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	BI4	P03879	638 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	CAN1	P04817	590 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	CMP2	P14747	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	ACE2	P21192	770 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YCR015C	P25616	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	SLA2	P33338	968 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
HRD1	YOL013C	YKL222C	P35995	705 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	GCN5	Q03330	439 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	ROT1	Q03691	256 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	ESC2	Q06340	456 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.11	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YLR358C	O13565	187 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	SPT20	P50875	604 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	RTA1	P53047	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	GAL10	P04397	699 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PIF1	P07271	859 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	FLR1	P38124	548 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	COG4	Q06096	861 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	SLX4	Q12098	748 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	NKP1	Q12493	238 aa		4.1	□□□□□ -1.75
HRD1	YOL013C	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.76	not detected
HRD1	YOL013C	MSH2	P25847	964 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	PLB2	Q03674	706 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	SND1	Q04007	877 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	RXT3	Q07458	294 aa		4.09	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.76	not detected
HRD1	YOL013C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	CIT1	P00890	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	AGP1	P25376	633 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	DOM34	P33309	386 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	GIP4	P39732	760 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	TAF1	P46677	1066 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	TFB2	Q02939	513 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	MSC2	Q03455	724 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	DUS4	Q06063	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	FMP25	Q08023	583 aa		4.08	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	PFD1	P46988	109 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	DAS1	P47005	663 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	YGR237C	P50089	785 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	ATG16	Q03818	150 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	HIR1	P32479	840 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	BET3	P36149	193 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	IES5	P40060	125 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	HFM1	P51979	1187 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	GPG1	P53130	126 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	TGL2	P54857	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	GPB1	Q08886	897 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	OSW2	Q12202	724 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	SFP1	P32432	683 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	HLJ1	P48353	224 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	MAL11	P53048	616 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	MTC3	P53077	123 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	YGR021W	P53212	290 aa		4.06	□□□□□ -1.76
HRD1	YOL013C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76

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