RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	CCL1	P37366	393 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YHR202W	P38887	602 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	RIM20	Q12033	661 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CDC16	P09798	840 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	WHI2	P12611	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
YNL057W	YNL057W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	EAF5	P39995	279 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CIT3	P43635	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PEX19	Q07418	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.05	□□□□□ -1.6	not detected
YNL057W	YNL057W	ISU2	Q12056	156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	SAF1	P38352	637 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	LAM5	P43560	674 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PHM6	Q05637	104 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	EST2	Q06163	884 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	CDC73	Q06697	393 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	HIF1	Q12373	385 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YPR015C	Q12531	247 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.03	□□□□□ -1.6	not detected
YNL057W	YNL057W	SPE1	P08432	466 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	SGF29	P25554	259 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	LEO1	P38439	464 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	RIM4	P38741	713 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	YAP1801	P38856	637 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ZAP1	P47043	880 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	AIM33	Q04516	312 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	NKP2	Q06162	153 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	HFI1	Q12060	488 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YNL057W	YNL057W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	HIS5	P07172	385 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	JJJ3	P47138	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	DIP5	P53388	608 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	CAF120	P53836	1060 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	YML053C	Q04978	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	ESC8	Q08119	714 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	SMC5	Q08204	1093 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	PIN2	Q12057	282 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	CIT2	P08679	460 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	RAD27	P26793	382 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	RXT2	P38255	430 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	ORC6	P38826	435 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	VID28	P40547	921 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	TAM41	P53230	385 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	GIS4	Q04233	774 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	YML083C	Q04526	418 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	COQ9	Q05779	260 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	MAS1	P10507	462 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	HMG2	P12684	1045 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	CLN3	P13365	580 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	PDE1	P22434	369 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	PEP3	P27801	918 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	TMT1	P32643	299 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	RAD54	P32863	898 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	MNR2	P35724	969 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	HEL1	P36113	551 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	AKR1	P39010	764 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	SFB2	P53953	876 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	NSE1	Q07913	336 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	PLP2	Q12017	286 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	YRR1	Q12172	810 aa		5	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	MSB2	P32334	1306 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	GLN3	P18494	730 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	PEX34	P25584	144 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YNL057W	YNL057W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 140.7 ms