RNA–Protein interactions for RNA: YHR180W-A

YHR180W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YHR180W-A, Length 183 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR180W-AYHR180W-A SPO74P45819 413 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A TOM22P49334 152 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A LYS4P49367 693 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A STB4P50104 949 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A TAF4P50105 388 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A CWH41P53008 833 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MIG2P53035 382 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SAP4P53036 818 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A ZIP2P53061 704 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A CGR1P53188 120 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A LSB1P53281 241 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A FPK1P53739 893 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A FOL1P53848 824 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A KRE33P53914 1056 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MRS2Q01926 470 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A HOS3Q02959 697 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MUB1Q03162 620 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RMD1Q03441 430 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A NSE5Q03718 556 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SAS4Q04003 481 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A UTP5Q04177 643 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RBS1Q05672 457 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YLR287CQ05881 355 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MMR1Q06324 491 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A EAF1Q06337 982 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A VPS36Q06696 566 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SYO1Q07395 620 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A LAP2Q10740 671 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A GNT1Q12096 491 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MED2Q12124 431 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YOR131CQ12486 218 aa2.33□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A STF1P01098 86 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
YHR180W-AYHR180W-A FUR4P05316 633 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A CDC16P09798 840 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A HOP09932 586 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A BIK1P11709 440 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A TRX1P22217 103 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PRP22P24384 1145 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A CLB3P24870 427 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MSH1P25846 959 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A EFT1P32324 842 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A FBP26P32604 452 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SFA1P32771 386 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MRP4P32902 394 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A CSE1P33307 960 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SEC66P33754 206 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PMT1P33775 817 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A STE13P33894 931 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A WHI3P34761 661 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A STV1P37296 890 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A BAP2P38084 609 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
YHR180W-AYHR180W-A PBY1P38254 753 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MSG5P38590 489 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MSR1P38714 643 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YHR219WP38900 624 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RTS1P38903 757 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YHB1P39676 399 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PSY2P40164 858 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data2.32□□□□□ -2.04not detected
YHR180W-AYHR180W-A CCT7P42943 550 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YFR006WP43590 535 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A BNA6P43619 295 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A NUP85P46673 744 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A FYV8P46949 817 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A POL32P47110 350 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SSN8P47821 323 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A TEA1P47988 759 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A UBA2P52488 636 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YKE2P52553 114 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YGL140CP53120 1219 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RPN14P53196 417 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SFB2P53953 876 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A BET4Q00618 327 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RPM2Q02773 1202 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A IRC4Q03036 179 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A TRS130Q03660 1102 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A INP2Q03824 705 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RBA50Q04418 439 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A LCB5Q06147 687 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A ATG17Q06410 417 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A MCP2Q06567 569 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A REH1Q06709 432 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A VAM6Q07468 1049 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A RSC58Q07979 502 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A SDH5Q08230 162 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A PPM2Q08282 695 aa2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
YHR180W-AYHR180W-A YPR204WQ08995 1032 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.9 ms