RNA–Protein interactions for RNA: YHL043W

ECM34, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene ECM34, Length 513 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECM34	YHL043W	PGS1	P25578	521 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SCD5	P34758	872 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	MXR1	P40029	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	EMP65	P40085	556 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	JEM1	P40358	645 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	HIS6	P40545	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	KXD1	P53158	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	CAF120	P53836	1060 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	GTR1	Q00582	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
ECM34	YHL043W	ULP1	Q02724	621 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SSM4	P40318	1319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	FLP1	P03870	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	RED1	P14291	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	IDI1	P15496	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	KTR4	P38131	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SEA4	P38164	1038 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	HXT5	P38695	592 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	POP2	P39008	433 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	FIR1	P40020	876 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	PIC2	P40035	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	RAD26	P40352	1085 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	NIT2	P47016	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	ENT3	P47160	408 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	SGD1	Q06132	899 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ECM34	YHL043W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	IQG1	Q12280	1495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	SAC3	P46674	1301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	VBA3	P25594	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	RAD16	P31244	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	SQT1	P35184	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	YBR287W	P38355	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	CCC2	P38995	1004 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	NTA1	P40354	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	YIL166C	P40445	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	XKS1	P42826	600 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	MEP3	P53390	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	ERF2	Q06551	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	ADY3	Q07732	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	RSC58	Q07979	502 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PGC1	Q08959	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	LAP2	Q10740	671 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	RMP1	Q12530	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	MCM1	P11746	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	FUN30	P31380	1131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
ECM34	YHL043W	SEG2	P34250	1132 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	LDH1	P38139	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PSY4	P38193	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	NPR3	P38742	1146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PSY2	P40164	858 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	GNP1	P48813	663 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	NPY1	P53164	384 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	COG8	Q04632	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	BLS1	Q06071	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	RKM4	Q12504	494 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	SEC2	P17065	759 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	VAC17	P25591	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	MKK2	P32491	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	UTR2	P32623	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	UGA4	P32837	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ECM34	YHL043W	BEM3	P32873	1128 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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