RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 IFT57Q9NWB7 429 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.42■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 CHRNA5P30532 468 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 CCDC27Q2M243 656 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 CNBD1Q8NA66 436 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 BCS1LQ9Y276 419 aa22.41■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 ADCY9O60503 1353 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 MYL6BP14649 208 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 PDIA6Q15084 440 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 SBF1O95248 1867 aa22.4■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
HERC3-214ENST00000601319 GNAI1P63096 354 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 MBIPQ9NS73 344 aa22.39■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 PDE6BP35913 854 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 ST5P78524 1137 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 HLFQ16534 295 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 KRT24Q2M2I5 525 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.37■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 H0YIN7 160 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.36■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 PROSER3Q2NL68 480 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 NGEFQ8N5V2 710 aa22.35■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 SLX4Q8IY92 1834 aa22.34■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 NPHP1O15259 732 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 WWC1Q8IX03 1113 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.33■■□□□ 1.17
HERC3-214ENST00000601319 IL16Q14005 1332 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 TTLL6Q8N841 843 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 LAMB2P55268 1798 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 CACNA1FO60840 1977 aa22.32■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 NYXQ9GZU5 481 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.31■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 ANXA1P04083 346 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 NECTIN2Q92692 538 aa22.3■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 SRGNP10124 158 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 STYK1Q6J9G0 422 aa22.29■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 ABCC12Q96J65 1359 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 PARP10Q53GL7 1025 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 COPS6Q7L5N1 327 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.28■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 HYPKQ9NX55 129 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.27■■□□□ 1.16
HERC3-214ENST00000601319 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 GPTP24298 496 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 MASTLQ96GX5 879 aa22.26■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 NTSR2O95665 410 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 CNKSR1Q969H4 720 aa22.25■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 FAM177BA6PVY3 158 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 NPR1P16066 1061 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 CRY2Q49AN0 593 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 SUSD4Q5VX71 490 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 WDR63Q8IWG1 891 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.24■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.23■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 ERFEQ4G0M1 354 aa22.22■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 TCIRG1Q13488 830 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.21■■□□□ 1.15
HERC3-214ENST00000601319 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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