RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-215ENST00000596522 MYL6BP14649 208 aa18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 CHD4Q14839 1912 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 TM4SF1P30408 202 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 PDIA6Q15084 440 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF428Q96B54 188 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.23■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 NUP98P52948 1817 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 DDR1Q08345 913 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 SLFN5Q08AF3 891 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.22■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 NFIXQ14938 502 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-215ENST00000596522 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 TSPYL6Q8N831 410 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 NECTIN2Q92692 538 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 GPR162Q16538 588 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 SETDB2Q96T68 719 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 ATP10DQ9P241 1426 aa18.19■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 VAMP4O75379 141 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 PROSER3Q2NL68 480 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 TBC1D9BQ66K14 1250 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 COPS6Q7L5N1 327 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.18■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 SERPINB2P05120 415 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.16■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 ANXA1P04083 346 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 TGFB2P61812 414 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 PARP10Q53GL7 1025 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 NYXQ9GZU5 481 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.14■□□□□ 0.5
FCHO1-215ENST00000596522 A0A0G2JLW4 131 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 NPHP1O15259 732 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.14■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 SLC4A2P04920 1241 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 DPEP1P16444 411 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 ST5P78524 1137 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 CNBD1Q8NA66 436 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.13■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 HLFQ16534 295 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 ALDH1L2Q3SY69 923 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 FLIIQ13045 1269 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 TCIRG1Q13488 830 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.11■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 KSR2Q6VAB6 950 aa18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 GRIN3BO60391 1043 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 KCNA3P22001 575 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC24Q8N4L8 307 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 CACNA1SQ13698 1873 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.08■□□□□ 0.49
FCHO1-215ENST00000596522 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 CHRNA5P30532 468 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 PDE6BP35913 854 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.08■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 PTPRCP08575 1304 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 YY1P25490 414 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 PIM2Q9P1W9 311 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 BCS1LQ9Y276 419 aa18.07■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 CACNA1FO60840 1977 aa18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-215ENST00000596522 GPTP24298 496 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms