RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591817.1

NPHS1-204, Transcript of NPHS1, nephrin, humanhuman

TSL 5

Gene NPHS1, Length 581 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS1-204ENST00000591817 NGEFQ8N5V2 710 aa20.46■□□□□ 0.87
NPHS1-204ENST00000591817 CHD4Q14839 1912 aa20.46■□□□□ 0.87
NPHS1-204ENST00000591817 IL16Q14005 1332 aa20.46■□□□□ 0.87
NPHS1-204ENST00000591817 MYL6BP14649 208 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 YY1P25490 414 aa20.45■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 PRR5LQ6MZQ0 368 aa20.45■□□□□ 0.86
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NPHS1-204ENST00000591817 PROSER3Q2NL68 480 aa20.44■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.44■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.44■□□□□ 0.86
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NPHS1-204ENST00000591817 PIM2Q9P1W9 311 aa20.43■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.43■□□□□ 0.86
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NPHS1-204ENST00000591817 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
NPHS1-204ENST00000591817 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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NPHS1-204ENST00000591817 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.4■□□□□ 0.86
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NPHS1-204ENST00000591817 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.4■□□□□ 0.86
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NPHS1-204ENST00000591817 RIC1Q4ADV7 1423 aa20.37■□□□□ 0.85
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NPHS1-204ENST00000591817 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.33■□□□□ 0.85
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NPHS1-204ENST00000591817 SUSD4Q5VX71 490 aa20.31■□□□□ 0.84
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NPHS1-204ENST00000591817 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 ERFEQ4G0M1 354 aa20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 NLRP10Q86W26 655 aa20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 NUTM1Q86Y26 1132 aa20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 GOLGA2Q08379 1002 aa20.27■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NPHS1-204ENST00000591817 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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