RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555995.1

CCDC88C-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88C, Length 689 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88C-210ENST00000555995 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.83■■□□□ 1.89
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CCDC88C-210ENST00000555995 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.82■■□□□ 1.88
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CCDC88C-210ENST00000555995 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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CCDC88C-210ENST00000555995 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
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CCDC88C-210ENST00000555995 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.7■■□□□ 1.86
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CCDC88C-210ENST00000555995 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.59■■□□□ 1.85
CCDC88C-210ENST00000555995 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CCDC88C-210ENST00000555995 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.59■■□□□ 1.85
CCDC88C-210ENST00000555995 ABCC12Q96J65 1359 aa26.58■■□□□ 1.85
CCDC88C-210ENST00000555995 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.58■■□□□ 1.85
CCDC88C-210ENST00000555995 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
CCDC88C-210ENST00000555995 SBF1O95248 1867 aa26.57■■□□□ 1.84
CCDC88C-210ENST00000555995 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.57■■□□□ 1.84
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