RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR162Q16538 588 aa14.91□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.91□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF26B4DH59 902 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CHL1O00533 1208 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 KRT24Q2M2I5 525 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF15Q8N660 670 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 CFAP44Q96MT7 982 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 MBIPQ9NS73 344 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 BCORQ6W2J9 1755 aa14.9□□□□□ -0.02
UBASH3B-208ENST00000533451 DDR1Q08345 913 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 NFIXQ14938 502 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 IFT57Q9NWB7 429 aa14.89□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 CAMTA2O94983 1202 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR29P0C7W0 189 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 WWC1Q8IX03 1113 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.87□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ANXA1P04083 346 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 SERPINB2P05120 415 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 SETDB2Q96T68 719 aa14.86□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM177BA6PVY3 158 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TM4SF1P30408 202 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC27Q2M243 656 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ERBB4Q15303 1308 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.85□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A0G2JLW4 131 aa14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 CCER2I3L3R5 266 aa14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 PROSER3Q2NL68 480 aa14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 NUP98P52948 1817 aa14.84□□□□□ -0.03
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF853P0CG23 659 aa14.83□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 DPEP1P16444 411 aa14.83□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.83□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CNBD1Q8NA66 436 aa14.83□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.83□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.82□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 HOXB7P09629 217 aa14.82□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.82□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GPTP24298 496 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CHRNA5P30532 468 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 TGFB2P61812 414 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ST5P78524 1137 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 HLFQ16534 295 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MIER1Q8N108 512 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 BCS1LQ9Y276 419 aa14.81□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PDIA6Q15084 440 aa14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 COPS6Q7L5N1 327 aa14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 IL16Q14005 1332 aa14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 CHD4Q14839 1912 aa14.8□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 GRIN3BO60391 1043 aa14.79□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.79□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.79□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 WDR63Q8IWG1 891 aa14.79□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.79□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 STK31Q9BXU1 1019 aa14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 HYPKQ9NX55 129 aa14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 PIM2Q9P1W9 311 aa14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.78□□□□□ -0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 H0YIN7 160 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 YY1P25490 414 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 GOLGA2Q08379 1002 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TSPYL6Q8N831 410 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.77□□□□□ -0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 CACNA1SQ13698 1873 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms