RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488180.1

SP100-216, Transcript of SP100 nuclear antigen, human

TSL 2

Gene SP100, Length 3,333 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP100-216	ENST00000488180	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	KCNA4	P22459	653 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	MCM5	P33992	734 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	TSC1	Q92574	1164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	IL13	P35225	146 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SLC34A2	O95436	690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SLC4A2	P04920	1241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	DDIT3	P35638	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	RTL9	Q8NET4	1388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SSFA2	P28290	1259 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PTGER2	P43116	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	OTOF	Q9HC10	1997 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	FAM177B	A6PVY3	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ZNF445	P59923	1031 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SP100-216	ENST00000488180		E9PSI1	815 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	APAF1	O14727	1248 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	SNX21	Q969T3	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	KCNJ4	P48050	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	LAMA4	Q16363	1823 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	HOXB7	P09629	217 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	IL2RB	P14784	551 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	MPND	Q8N594	471 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.51	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	PROM2	Q8N271	834 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	IL16	Q14005	1332 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	SYCE3	A1L190	88 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	FOXO3	O43524	673 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	RLBP1	P12271	317 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SP100-216	ENST00000488180	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.5	□□□□□ -1.69

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