RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419542.3

PCBP1-AS1-214, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PCBP1-AS1, Length 1,309 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHRNA5P30532 468 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PDIA6Q15084 440 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCDC27Q2M243 656 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PROSER3Q2NL68 480 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KIF6Q6ZMV9 814 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BCORQ6W2J9 1755 aa18.38■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.37■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa18.37■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.37■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BCS1LQ9Y276 419 aa18.37■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FAM177BA6PVY3 158 aa18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KCNA3P22001 575 aa18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHD4Q14839 1912 aa18.36■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CNBD1Q8NA66 436 aa18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PIM2Q9P1W9 311 aa18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHPF2Q9P2E5 772 aa18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.35■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 COPS6Q7L5N1 327 aa18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 C8orf58Q8NAV2 365 aa18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NUP98P52948 1817 aa18.33■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HOXB7P09629 217 aa18.33■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 XAGE3Q8WTP9 111 aa18.33■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 H0YIN7 160 aa18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RGL2O15211 777 aa18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ST5P78524 1137 aa18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GPTP24298 496 aa18.31■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.31■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.31■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PDE6BP35913 854 aa18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TSPYL6Q8N831 410 aa18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 IL16Q14005 1332 aa18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 WDR63Q8IWG1 891 aa18.29■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.29■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCER2I3L3R5 266 aa18.28■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.28■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HYPKQ9NX55 129 aa18.28■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF34Q8IZ26 560 aa18.27■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.27■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SUSD4Q5VX71 490 aa18.26■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa18.26■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.26■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TTLL6Q8N841 843 aa18.26■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ATP10DQ9P241 1426 aa18.26■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.26■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NYXQ9GZU5 481 aa18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ERFEQ4G0M1 354 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MIER1Q8N108 512 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PLBD2Q8NHP8 589 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF428Q96B54 188 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 GOLGA2Q08379 1002 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 TCIRG1Q13488 830 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 SRGNP10124 158 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 PARP10Q53GL7 1025 aa18.23■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 RIC3Q7Z5B4 369 aa18.22■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MASTLQ96GX5 879 aa18.22■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 STK31Q9BXU1 1019 aa18.22■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.22■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa18.21■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NTSR2O95665 410 aa18.21■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 STYK1Q6J9G0 422 aa18.21■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 ABCC12Q96J65 1359 aa18.2■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 CACNA1SQ13698 1873 aa18.2■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 C21orf2O43822 256 aa18.2■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-214ENST00000419542 NPR1P16066 1061 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms