RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CAMTA2O94983 1202 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF853P0CG23 659 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYL6BP14649 208 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GNAI1P63096 354 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NFIXQ14938 502 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC27Q2M243 656 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WWC1Q8IX03 1113 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PARP3Q9Y6F1 533 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUP98P52948 1817 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PXDNLA1KZ92 1463 aa13.33□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCER2I3L3R5 266 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANXA1P04083 346 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NGEFQ8N5V2 710 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CD2APQ9Y5K6 639 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa13.32□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PROSER3Q2NL68 480 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TBC1D9BQ66K14 1250 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WWC3Q9ULE0 1092 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERBB4Q15303 1308 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CARMIL3Q8ND23 1372 aa13.31□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DLEC1Q9Y238 1755 aa13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TM4SF1P30408 202 aa13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DUSP27Q5VZP5 1158 aa13.3□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDIA6Q15084 440 aa13.29□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.29□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHPF2Q9P2E5 772 aa13.29□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa13.29□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SERPINB2P05120 415 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HOXB7P09629 217 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HLFQ16534 295 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF6Q6ZMV9 814 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP10Q7Z4F1 713 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZBTB3Q9H5J0 574 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF652Q9Y2D9 606 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IL16Q14005 1332 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP10DQ9P241 1426 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UTRNP46939 3433 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CACNA1SQ13698 1873 aa13.27□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPR162Q16538 588 aa13.26□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC24Q8N4L8 307 aa13.26□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TSPYL6Q8N831 410 aa13.26□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF521Q96K83 1311 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0G2JLW4 131 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPDYE2BA6NHP3 402 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPDYE6P0CI01 402 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DPEP1P16444 411 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPDYE2Q495Y8 402 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR5LQ6MZQ0 368 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WDR63Q8IWG1 891 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XAGE3Q8WTP9 111 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SETDB2Q96T68 719 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHD4Q14839 1912 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa13.25□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM177BA6PVY3 158 aa13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGL2O15211 777 aa13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHRNA5P30532 468 aa13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COPS6Q7L5N1 327 aa13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CNBD1Q8NA66 436 aa13.24□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NPHP1O15259 732 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPTP24298 496 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TGFB2P61812 414 aa13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCC12Q96J65 1359 aa13.22□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCNA3P22001 575 aa13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ST5P78524 1137 aa13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GOLGA2Q08379 1002 aa13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HYPKQ9NX55 129 aa13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.21□□□□□ -0.29
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LAMB2P55268 1798 aa13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C2CD5Q86YS7 1000 aa13.2□□□□□ -0.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms