RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1390Q8VGW9 311 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Art4Q9CRA0 300 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mgme1Q9CXC3 338 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn1r29Q9EQ41 303 aa21.89■■□□□ 1.1
Suds3-201ENSMUST00000086471 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Spin2eJ3QNQ0 234 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc6a6O35316 621 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rab17P35292 214 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgap39P59281 1107 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Drd2P61168 444 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pin1rt1Q3ULQ2 159 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mapre3Q6PER3 281 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcoln3Q8R4F0 553 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr599Q8VG01 315 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 HnrnpabQ99020 285 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc25Q9D4B2 624 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rhox9Q9EQM5 227 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ap3m1Q9JKC8 418 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Srpk3Q9Z0G2 565 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cldn6Q9Z262 219 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dock4P59764 1978 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa21.89■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc43a3A2AVZ9 502 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 H60cB1B213 197 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 CfpP11680 464 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arf3P61205 181 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 PtnP63089 168 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fahd2Q3TC72 313 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ahi1Q8K3E5 1047 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem35aQ9D328 167 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 P2ry2P35383 373 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ift52Q62559 426 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irak2Q8CFA1 622 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dcbld2Q91ZV3 769 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prl8a8Q9DAS4 241 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ifi30Q9ESY9 248 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tcea2Q9QVN7 299 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 DstnQ9R0P5 165 aa21.88■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 4930595M18RikA2RRY9 829 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 TagapB2RWW0 714 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mterf1bB9EJ57 379 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tgfbr3lD3YZZ2 297 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr237-ps1K9J725 310 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nipsnap2O55126 281 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rps15aP62245 130 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr629Q0VBH3 314 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Phf12Q5SPL2 1003 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1134Q7TR43 312 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nrde2Q80XC6 1172 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Angptl2Q9R045 493 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trav1A0A075B5Z4 110 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01667 111 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 MagP20917 626 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccnb2P30276 398 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atxn1P54254 791 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Polr2iP60898 125 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fgf1P61148 155 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ulk3Q3U3Q1 472 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam196aQ3USH1 422 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyb5d2Q5SSH8 263 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Glt8d2Q640P4 349 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Elfn2Q68FM6 823 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wdr91Q7TMQ7 748 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lrrc75bQ7TPD7 306 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr699Q7TRN3 316 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mfn1Q811U4 741 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf639Q99KZ6 485 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 MrgprhQ99MT8 321 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pbld1Q9DCG6 288 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Greb1Q3UHK3 1954 aa21.87■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm15821A6X8J8 139 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klhl3E0CZ16 587 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r92L7N2A4 860 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Alox5P48999 674 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nat3P50296 290 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nup43P59235 380 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptpn2Q06180 406 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdk6Q64261 326 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Snx6Q6P8X1 406 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pomgnt2Q8BW41 605 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Piwil2Q8CDG1 971 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rab43Q8CG50 210 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Asb17Q8VHP9 295 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Laptm4bQ91XQ6 227 aa21.86■■□□□ 1.09
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf524Q9D0B1 321 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.3 ms