Protein–RNA interactions for Protein: Q6PER3

Mapre3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mapre3Q6PER3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,2■■■■□ 3,07
Mapre3Q6PER3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Mapre3Q6PER3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,69
Mapre3Q6PER3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Mapre3Q6PER3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Mapre3Q6PER3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Mapre3Q6PER3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,51■■■□□ 2,47
Mapre3Q6PER3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Mapre3Q6PER3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,36■■■□□ 2,45
Mapre3Q6PER3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Mapre3Q6PER3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Mapre3Q6PER3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Mapre3Q6PER3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Mapre3Q6PER3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Mapre3Q6PER3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Mapre3Q6PER3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Mapre3Q6PER3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mapre3Q6PER3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mapre3Q6PER3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Mapre3Q6PER3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Mapre3Q6PER3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Mapre3Q6PER3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Mapre3Q6PER3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Mapre3Q6PER3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Mapre3Q6PER3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Mapre3Q6PER3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Mapre3Q6PER3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Mapre3Q6PER3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Mapre3Q6PER3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Mapre3Q6PER3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Mapre3Q6PER3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Mapre3Q6PER3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Mapre3Q6PER3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Mapre3Q6PER3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Mapre3Q6PER3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Mapre3Q6PER3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Mapre3Q6PER3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mapre3Q6PER3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Mapre3Q6PER3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Mapre3Q6PER3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Mapre3Q6PER3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Mapre3Q6PER3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Mapre3Q6PER3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Mapre3Q6PER3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Mapre3Q6PER3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Mapre3Q6PER3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Mapre3Q6PER3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Mapre3Q6PER3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Mapre3Q6PER3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Mapre3Q6PER3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Mapre3Q6PER3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Mapre3Q6PER3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Mapre3Q6PER3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Mapre3Q6PER3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Mapre3Q6PER3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Mapre3Q6PER3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Mapre3Q6PER3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Mapre3Q6PER3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Mapre3Q6PER3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Mapre3Q6PER3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Mapre3Q6PER3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Mapre3Q6PER3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Mapre3Q6PER3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Mapre3Q6PER3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Mapre3Q6PER3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Mapre3Q6PER3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Mapre3Q6PER3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Mapre3Q6PER3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Mapre3Q6PER3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Mapre3Q6PER3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Mapre3Q6PER3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Mapre3Q6PER3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Mapre3Q6PER3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Mapre3Q6PER3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Mapre3Q6PER3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Mapre3Q6PER3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Mapre3Q6PER3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Mapre3Q6PER3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Mapre3Q6PER3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Mapre3Q6PER3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Mapre3Q6PER3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Mapre3Q6PER3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Mapre3Q6PER3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Mapre3Q6PER3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Mapre3Q6PER3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Mapre3Q6PER3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Mapre3Q6PER3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Mapre3Q6PER3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Mapre3Q6PER3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Mapre3Q6PER3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Mapre3Q6PER3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Mapre3Q6PER3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Mapre3Q6PER3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Mapre3Q6PER3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Mapre3Q6PER3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Mapre3Q6PER3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Mapre3Q6PER3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Mapre3Q6PER3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Mapre3Q6PER3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Mapre3Q6PER3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms