Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW41

Pomgnt2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pomgnt2Q8BW41 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,24■■■■□ 3,23
Pomgnt2Q8BW41 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Pomgnt2Q8BW41 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Pomgnt2Q8BW41 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Pomgnt2Q8BW41 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Pomgnt2Q8BW41 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,2■■■□□ 2,59
Pomgnt2Q8BW41 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Pomgnt2Q8BW41 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,49■■■□□ 2,47
Pomgnt2Q8BW41 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,31■■■□□ 2,44
Pomgnt2Q8BW41 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Pomgnt2Q8BW41 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Pomgnt2Q8BW41 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,7■■■□□ 2,34
Pomgnt2Q8BW41 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Pomgnt2Q8BW41 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Pomgnt2Q8BW41 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Pomgnt2Q8BW41 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Pomgnt2Q8BW41 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Pomgnt2Q8BW41 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Pomgnt2Q8BW41 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Pomgnt2Q8BW41 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Pomgnt2Q8BW41 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Pomgnt2Q8BW41 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pomgnt2Q8BW41 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Pomgnt2Q8BW41 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Pomgnt2Q8BW41 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Pomgnt2Q8BW41 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Pomgnt2Q8BW41 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Pomgnt2Q8BW41 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,83■■■□□ 2,21
Pomgnt2Q8BW41 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Pomgnt2Q8BW41 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Pomgnt2Q8BW41 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Pomgnt2Q8BW41 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Pomgnt2Q8BW41 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Pomgnt2Q8BW41 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Pomgnt2Q8BW41 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Pomgnt2Q8BW41 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Pomgnt2Q8BW41 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Pomgnt2Q8BW41 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Pomgnt2Q8BW41 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Pomgnt2Q8BW41 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Pomgnt2Q8BW41 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pomgnt2Q8BW41 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Pomgnt2Q8BW41 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Pomgnt2Q8BW41 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Pomgnt2Q8BW41 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Pomgnt2Q8BW41 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pomgnt2Q8BW41 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Pomgnt2Q8BW41 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Pomgnt2Q8BW41 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pomgnt2Q8BW41 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Pomgnt2Q8BW41 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Pomgnt2Q8BW41 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Pomgnt2Q8BW41 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Pomgnt2Q8BW41 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Pomgnt2Q8BW41 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Pomgnt2Q8BW41 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Pomgnt2Q8BW41 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Pomgnt2Q8BW41 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pomgnt2Q8BW41 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Pomgnt2Q8BW41 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Pomgnt2Q8BW41 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pomgnt2Q8BW41 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pomgnt2Q8BW41 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pomgnt2Q8BW41 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pomgnt2Q8BW41 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Pomgnt2Q8BW41 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Pomgnt2Q8BW41 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pomgnt2Q8BW41 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Pomgnt2Q8BW41 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Pomgnt2Q8BW41 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pomgnt2Q8BW41 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pomgnt2Q8BW41 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pomgnt2Q8BW41 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pomgnt2Q8BW41 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pomgnt2Q8BW41 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,94■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Pomgnt2Q8BW41 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Pomgnt2Q8BW41 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Pomgnt2Q8BW41 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pomgnt2Q8BW41 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Pomgnt2Q8BW41 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pomgnt2Q8BW41 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pomgnt2Q8BW41 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pomgnt2Q8BW41 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Pomgnt2Q8BW41 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Pomgnt2Q8BW41 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Pomgnt2Q8BW41 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Pomgnt2Q8BW41 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,83
Pomgnt2Q8BW41 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Pomgnt2Q8BW41 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pomgnt2Q8BW41 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,4■■□□□ 1,82
Pomgnt2Q8BW41 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Pomgnt2Q8BW41 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Pomgnt2Q8BW41 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Pomgnt2Q8BW41 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms