Protein–RNA interactions for Protein: P20917

Mag, Myelin-associated glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MagP20917 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
MagP20917 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MagP20917 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MagP20917 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MagP20917 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
MagP20917 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
MagP20917 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
MagP20917 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
MagP20917 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MagP20917 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MagP20917 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MagP20917 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MagP20917 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
MagP20917 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MagP20917 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MagP20917 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
MagP20917 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MagP20917 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MagP20917 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
MagP20917 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MagP20917 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MagP20917 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MagP20917 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MagP20917 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MagP20917 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MagP20917 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MagP20917 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MagP20917 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MagP20917 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MagP20917 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MagP20917 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MagP20917 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MagP20917 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MagP20917 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MagP20917 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MagP20917 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MagP20917 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MagP20917 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MagP20917 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MagP20917 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MagP20917 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MagP20917 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MagP20917 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MagP20917 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MagP20917 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MagP20917 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MagP20917 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MagP20917 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MagP20917 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MagP20917 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MagP20917 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MagP20917 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MagP20917 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MagP20917 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MagP20917 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MagP20917 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MagP20917 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MagP20917 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MagP20917 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MagP20917 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MagP20917 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MagP20917 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MagP20917 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MagP20917 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MagP20917 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MagP20917 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MagP20917 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MagP20917 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MagP20917 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MagP20917 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MagP20917 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MagP20917 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MagP20917 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MagP20917 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MagP20917 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MagP20917 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MagP20917 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MagP20917 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MagP20917 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MagP20917 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MagP20917 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MagP20917 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MagP20917 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MagP20917 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MagP20917 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MagP20917 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MagP20917 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MagP20917 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MagP20917 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MagP20917 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MagP20917 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MagP20917 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MagP20917 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MagP20917 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MagP20917 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MagP20917 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MagP20917 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MagP20917 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MagP20917 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MagP20917 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms