RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rgs18Q99PG4 235 aa12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LipfQ9CPP7 395 aa12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Stx11Q9D3G5 287 aa12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 ItpaQ9D892 198 aa12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dgat2Q9DCV3 388 aa12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aph1cQ9DCZ9 258 aa12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ak4Q9WUR9 223 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aadacl2B2RWD2 401 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10608E9PZ13 166 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RaxO35602 342 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fcgr2P08101 330 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acvr2aP27038 513 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fpr1P33766 364 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Igfbp5Q07079 271 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem248Q3TBN1 314 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ugt2b36Q3UEP4 530 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CrxosQ3UL53 246 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mvb12aQ78HU3 271 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1307Q7TQX1 312 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr871Q7TRF0 311 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam149aQ8CFV2 787 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr551Q8VG23 315 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fitm1Q91V79 292 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pbdc1Q9D0B6 198 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lcn9Q9D267 178 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aar2Q9D2V5 384 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adad2Q9D5P4 478 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Upk3bl1Q9D701 249 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lman2Q9DBH5 358 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sphk2Q9JIA7 617 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Herpud2Q9JJC9 404 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mid2Q9QUS6 705 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phc2Q9QWH1 850 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clca3a1Q9QX15 902 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hspb3Q9QZ57 154 aa12.96□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm8926L7MUE8 181 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rb1P13405 921 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Drd2P61168 444 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ezh1P70351 747 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ica1P97411 478 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rgs14P97492 547 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fads2p1Q0VAX3 487 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp280bQ505F4 534 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fzd3Q61086 666 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Map4k2Q61161 821 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AktipQ64362 292 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MdficQ8BX65 247 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prkd3Q8K1Y2 889 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 RorbQ8R1B8 470 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ndufs2Q91WD5 463 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zswim2Q9D9X6 631 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q9DAD0 168 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pop7Q9DCH2 140 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r52Q9EP79 309 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adam23Q9R1V7 829 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r77E9PY60 306 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psmc3ipO35047 217 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc6a6O35316 621 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rdh5O55240 318 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tgfb3P17125 410 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1qaP98086 245 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr629Q0VBH3 314 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fbxl22Q8C7B6 236 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zbtb9Q8CDC7 459 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf222Q8CEF8 211 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prokr2Q8K458 381 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc38a4Q8R1S9 547 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r201Q8R262 300 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PrkraQ9WTX2 313 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nrg4Q9WTX4 115 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Uba2Q9Z1F9 638 aa12.95□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm6592A2AHC7 168 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1247A2AT78 314 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rnf39A2RT81 352 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankle1A8VU90 534 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28048F7BCN0 99 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Aldh1a7O35945 501 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mtnd2P03893 345 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CtslP06797 334 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hoxb3P09026 433 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hsd3b1P24815 373 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppm1bP36993 390 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hsf2P38533 535 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OcmP51879 109 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccser2Q3UHI0 833 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q3USZ8 430 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nsg1Q62092 185 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Osgepl1Q6PEB4 414 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Adamtsl2Q7TSK7 957 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf592Q8BHZ4 1262 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Palm2Q8BR92 376 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nlgn3Q8BYM5 825 aa12.94□□□□□ -0.34
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hbp1Q8R316 516 aa12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.4 ms