Protein–RNA interactions for Protein: Q61086

Fzd3, Frizzled-3, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd3Q61086 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Fzd3Q61086 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Fzd3Q61086 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fzd3Q61086 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Fzd3Q61086 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Fzd3Q61086 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Fzd3Q61086 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Fzd3Q61086 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fzd3Q61086 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fzd3Q61086 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fzd3Q61086 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fzd3Q61086 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Fzd3Q61086 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fzd3Q61086 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fzd3Q61086 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fzd3Q61086 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fzd3Q61086 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fzd3Q61086 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fzd3Q61086 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fzd3Q61086 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fzd3Q61086 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fzd3Q61086 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fzd3Q61086 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Fzd3Q61086 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Fzd3Q61086 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Fzd3Q61086 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Fzd3Q61086 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Fzd3Q61086 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Fzd3Q61086 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Fzd3Q61086 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Fzd3Q61086 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Fzd3Q61086 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Fzd3Q61086 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Fzd3Q61086 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Fzd3Q61086 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Fzd3Q61086 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fzd3Q61086 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fzd3Q61086 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fzd3Q61086 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fzd3Q61086 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fzd3Q61086 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fzd3Q61086 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fzd3Q61086 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fzd3Q61086 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fzd3Q61086 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Fzd3Q61086 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fzd3Q61086 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Fzd3Q61086 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Fzd3Q61086 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Fzd3Q61086 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fzd3Q61086 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fzd3Q61086 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fzd3Q61086 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fzd3Q61086 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fzd3Q61086 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fzd3Q61086 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fzd3Q61086 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fzd3Q61086 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fzd3Q61086 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fzd3Q61086 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Fzd3Q61086 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fzd3Q61086 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fzd3Q61086 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fzd3Q61086 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fzd3Q61086 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fzd3Q61086 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fzd3Q61086 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fzd3Q61086 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Fzd3Q61086 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fzd3Q61086 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fzd3Q61086 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Fzd3Q61086 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fzd3Q61086 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fzd3Q61086 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fzd3Q61086 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fzd3Q61086 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fzd3Q61086 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fzd3Q61086 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fzd3Q61086 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fzd3Q61086 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fzd3Q61086 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fzd3Q61086 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fzd3Q61086 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fzd3Q61086 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Fzd3Q61086 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Fzd3Q61086 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Fzd3Q61086 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fzd3Q61086 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Fzd3Q61086 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fzd3Q61086 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fzd3Q61086 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fzd3Q61086 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Fzd3Q61086 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms