Protein–RNA interactions for Protein: P51879

Ocm, Oncomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OcmP51879 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,17■■■□□ 2,9
OcmP51879 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
OcmP51879 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,31■■■□□ 2,6
OcmP51879 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,21■■■□□ 2,59
OcmP51879 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
OcmP51879 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
OcmP51879 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
OcmP51879 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
OcmP51879 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
OcmP51879 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
OcmP51879 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
OcmP51879 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
OcmP51879 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
OcmP51879 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
OcmP51879 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
OcmP51879 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
OcmP51879 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
OcmP51879 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
OcmP51879 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
OcmP51879 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
OcmP51879 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
OcmP51879 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
OcmP51879 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
OcmP51879 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
OcmP51879 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
OcmP51879 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
OcmP51879 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
OcmP51879 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
OcmP51879 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
OcmP51879 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
OcmP51879 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
OcmP51879 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
OcmP51879 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
OcmP51879 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
OcmP51879 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
OcmP51879 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
OcmP51879 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
OcmP51879 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
OcmP51879 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
OcmP51879 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
OcmP51879 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
OcmP51879 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
OcmP51879 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
OcmP51879 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
OcmP51879 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,53■■■□□ 2
OcmP51879 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
OcmP51879 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
OcmP51879 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
OcmP51879 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
OcmP51879 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,3■■□□□ 1,96
OcmP51879 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
OcmP51879 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
OcmP51879 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
OcmP51879 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
OcmP51879 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
OcmP51879 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
OcmP51879 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
OcmP51879 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
OcmP51879 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
OcmP51879 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
OcmP51879 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
OcmP51879 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
OcmP51879 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
OcmP51879 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
OcmP51879 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
OcmP51879 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
OcmP51879 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
OcmP51879 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
OcmP51879 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
OcmP51879 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
OcmP51879 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
OcmP51879 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
OcmP51879 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
OcmP51879 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
OcmP51879 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
OcmP51879 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
OcmP51879 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
OcmP51879 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,2■■□□□ 1,78
OcmP51879 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
OcmP51879 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
OcmP51879 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
OcmP51879 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
OcmP51879 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
OcmP51879 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
OcmP51879 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
OcmP51879 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
OcmP51879 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
OcmP51879 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
OcmP51879 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
OcmP51879 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
OcmP51879 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
OcmP51879 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
OcmP51879 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
OcmP51879 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
OcmP51879 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
OcmP51879 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
OcmP51879 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
OcmP51879 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,84■■□□□ 1,73
OcmP51879 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
OcmP51879 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,6 ms