Protein–RNA interactions for Protein: E9PY60

Vmn1r77, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r77E9PY60 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,37■■■□□ 2,77
Vmn1r77E9PY60 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Vmn1r77E9PY60 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Vmn1r77E9PY60 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,86■■■□□ 2,53
Vmn1r77E9PY60 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Vmn1r77E9PY60 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Vmn1r77E9PY60 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Vmn1r77E9PY60 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Vmn1r77E9PY60 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Vmn1r77E9PY60 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Vmn1r77E9PY60 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Vmn1r77E9PY60 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Vmn1r77E9PY60 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Vmn1r77E9PY60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Vmn1r77E9PY60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Vmn1r77E9PY60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Vmn1r77E9PY60 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Vmn1r77E9PY60 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Vmn1r77E9PY60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Vmn1r77E9PY60 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Vmn1r77E9PY60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Vmn1r77E9PY60 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Vmn1r77E9PY60 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Vmn1r77E9PY60 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Vmn1r77E9PY60 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Vmn1r77E9PY60 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Vmn1r77E9PY60 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Vmn1r77E9PY60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Vmn1r77E9PY60 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Vmn1r77E9PY60 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Vmn1r77E9PY60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Vmn1r77E9PY60 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Vmn1r77E9PY60 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Vmn1r77E9PY60 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Vmn1r77E9PY60 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Vmn1r77E9PY60 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Vmn1r77E9PY60 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Vmn1r77E9PY60 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Vmn1r77E9PY60 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Vmn1r77E9PY60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Vmn1r77E9PY60 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Vmn1r77E9PY60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Vmn1r77E9PY60 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Vmn1r77E9PY60 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Vmn1r77E9PY60 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Vmn1r77E9PY60 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Vmn1r77E9PY60 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Vmn1r77E9PY60 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vmn1r77E9PY60 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Vmn1r77E9PY60 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vmn1r77E9PY60 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Vmn1r77E9PY60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Vmn1r77E9PY60 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vmn1r77E9PY60 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Vmn1r77E9PY60 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vmn1r77E9PY60 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Vmn1r77E9PY60 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Vmn1r77E9PY60 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Vmn1r77E9PY60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Vmn1r77E9PY60 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Vmn1r77E9PY60 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Vmn1r77E9PY60 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Vmn1r77E9PY60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Vmn1r77E9PY60 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Vmn1r77E9PY60 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Vmn1r77E9PY60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Vmn1r77E9PY60 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Vmn1r77E9PY60 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Vmn1r77E9PY60 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Vmn1r77E9PY60 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Vmn1r77E9PY60 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Vmn1r77E9PY60 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Vmn1r77E9PY60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Vmn1r77E9PY60 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Vmn1r77E9PY60 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Vmn1r77E9PY60 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Vmn1r77E9PY60 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Vmn1r77E9PY60 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Vmn1r77E9PY60 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Vmn1r77E9PY60 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Vmn1r77E9PY60 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Vmn1r77E9PY60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Vmn1r77E9PY60 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Vmn1r77E9PY60 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Vmn1r77E9PY60 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Vmn1r77E9PY60 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Vmn1r77E9PY60 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Vmn1r77E9PY60 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Vmn1r77E9PY60 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Vmn1r77E9PY60 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Vmn1r77E9PY60 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Vmn1r77E9PY60 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Vmn1r77E9PY60 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Vmn1r77E9PY60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Vmn1r77E9PY60 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
Vmn1r77E9PY60 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Vmn1r77E9PY60 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Vmn1r77E9PY60 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Vmn1r77E9PY60 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Vmn1r77E9PY60 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,1 ms