Protein–RNA interactions for Protein: P27038

Acvr2a, Activin receptor type-2A, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr2aP27038 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Acvr2aP27038 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Acvr2aP27038 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Acvr2aP27038 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Acvr2aP27038 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Acvr2aP27038 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Acvr2aP27038 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Acvr2aP27038 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Acvr2aP27038 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Acvr2aP27038 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Acvr2aP27038 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Acvr2aP27038 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Acvr2aP27038 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Acvr2aP27038 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Acvr2aP27038 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Acvr2aP27038 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Acvr2aP27038 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Acvr2aP27038 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Acvr2aP27038 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Acvr2aP27038 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Acvr2aP27038 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Acvr2aP27038 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Acvr2aP27038 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Acvr2aP27038 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Acvr2aP27038 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Acvr2aP27038 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Acvr2aP27038 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Acvr2aP27038 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Acvr2aP27038 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Acvr2aP27038 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Acvr2aP27038 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Acvr2aP27038 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Acvr2aP27038 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Acvr2aP27038 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Acvr2aP27038 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Acvr2aP27038 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Acvr2aP27038 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Acvr2aP27038 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Acvr2aP27038 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Acvr2aP27038 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Acvr2aP27038 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Acvr2aP27038 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Acvr2aP27038 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Acvr2aP27038 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Acvr2aP27038 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Acvr2aP27038 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Acvr2aP27038 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Acvr2aP27038 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Acvr2aP27038 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Acvr2aP27038 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Acvr2aP27038 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Acvr2aP27038 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Acvr2aP27038 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acvr2aP27038 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Acvr2aP27038 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acvr2aP27038 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acvr2aP27038 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acvr2aP27038 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acvr2aP27038 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Acvr2aP27038 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Acvr2aP27038 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Acvr2aP27038 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Acvr2aP27038 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Acvr2aP27038 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Acvr2aP27038 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Acvr2aP27038 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Acvr2aP27038 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Acvr2aP27038 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Acvr2aP27038 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Acvr2aP27038 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Acvr2aP27038 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Acvr2aP27038 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Acvr2aP27038 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Acvr2aP27038 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Acvr2aP27038 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Acvr2aP27038 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Acvr2aP27038 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Acvr2aP27038 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Acvr2aP27038 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Acvr2aP27038 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Acvr2aP27038 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Acvr2aP27038 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acvr2aP27038 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acvr2aP27038 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acvr2aP27038 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acvr2aP27038 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acvr2aP27038 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acvr2aP27038 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Acvr2aP27038 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Acvr2aP27038 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acvr2aP27038 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acvr2aP27038 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Acvr2aP27038 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acvr2aP27038 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms