Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ57

Hspb3, Heat shock protein beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspb3Q9QZ57 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,17■■■■□ 3,06
Hspb3Q9QZ57 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Hspb3Q9QZ57 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Hspb3Q9QZ57 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Hspb3Q9QZ57 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Hspb3Q9QZ57 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Hspb3Q9QZ57 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Hspb3Q9QZ57 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
Hspb3Q9QZ57 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Hspb3Q9QZ57 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Hspb3Q9QZ57 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Hspb3Q9QZ57 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Hspb3Q9QZ57 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Hspb3Q9QZ57 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Hspb3Q9QZ57 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Hspb3Q9QZ57 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Hspb3Q9QZ57 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Hspb3Q9QZ57 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Hspb3Q9QZ57 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Hspb3Q9QZ57 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Hspb3Q9QZ57 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hspb3Q9QZ57 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Hspb3Q9QZ57 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Hspb3Q9QZ57 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Hspb3Q9QZ57 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Hspb3Q9QZ57 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Hspb3Q9QZ57 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Hspb3Q9QZ57 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,54■■■□□ 2,16
Hspb3Q9QZ57 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Hspb3Q9QZ57 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Hspb3Q9QZ57 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Hspb3Q9QZ57 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Hspb3Q9QZ57 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Hspb3Q9QZ57 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hspb3Q9QZ57 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Hspb3Q9QZ57 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Hspb3Q9QZ57 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Hspb3Q9QZ57 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Hspb3Q9QZ57 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Hspb3Q9QZ57 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Hspb3Q9QZ57 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Hspb3Q9QZ57 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Hspb3Q9QZ57 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hspb3Q9QZ57 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Hspb3Q9QZ57 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,55■■■□□ 2
Hspb3Q9QZ57 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Hspb3Q9QZ57 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Hspb3Q9QZ57 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Hspb3Q9QZ57 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Hspb3Q9QZ57 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Hspb3Q9QZ57 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Hspb3Q9QZ57 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Hspb3Q9QZ57 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hspb3Q9QZ57 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Hspb3Q9QZ57 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hspb3Q9QZ57 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Hspb3Q9QZ57 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hspb3Q9QZ57 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hspb3Q9QZ57 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Hspb3Q9QZ57 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Hspb3Q9QZ57 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hspb3Q9QZ57 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Hspb3Q9QZ57 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Hspb3Q9QZ57 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Hspb3Q9QZ57 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Hspb3Q9QZ57 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Hspb3Q9QZ57 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Hspb3Q9QZ57 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Hspb3Q9QZ57 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Hspb3Q9QZ57 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Hspb3Q9QZ57 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Hspb3Q9QZ57 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,84
Hspb3Q9QZ57 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Hspb3Q9QZ57 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Hspb3Q9QZ57 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Hspb3Q9QZ57 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Hspb3Q9QZ57 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Hspb3Q9QZ57 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Hspb3Q9QZ57 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Hspb3Q9QZ57 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Hspb3Q9QZ57 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Hspb3Q9QZ57 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Hspb3Q9QZ57 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Hspb3Q9QZ57 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Hspb3Q9QZ57 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Hspb3Q9QZ57 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Hspb3Q9QZ57 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Hspb3Q9QZ57 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hspb3Q9QZ57 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hspb3Q9QZ57 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hspb3Q9QZ57 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hspb3Q9QZ57 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hspb3Q9QZ57 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Hspb3Q9QZ57 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60,6 ms