RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	UGCG	Q16739	394 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	XKR8	Q9H6D3	395 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MANBA	O00462	879 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	AXIN1	O15169	862 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ACOX3	O15254	700 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PEX10	O60683	326 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	GLB1	P16278	677 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CTH	P32929	405 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PRPS1	P60891	318 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	NTRK2	Q16620	822 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	NOXA1	Q86UR1	476 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	OR2T4	Q8NH00	348 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM80	Q96HE8	168 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	IGSF21	Q96ID5	467 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	SFXN2	Q96NB2	322 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RNF19A	Q9NV58	838 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874		A0A0G2JNG1	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874		A0A0G2JPF8	293 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	LRRN3	E7EW58	273 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CD72	P21854	359 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	NMBR	P28336	390 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	KIR2DS5	Q14953	304 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	AARD	Q4LEZ3	155 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	XKRX	Q6PP77	449 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	BOD1	Q96IK1	185 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	REEP4	Q9H6H4	257 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PNPO	Q9NVS9	261 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MYH1	P12882	1939 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874		J3QLW9	94 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CNTN5	O94779	1100 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CSN2	P05814	226 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	FABP1	P07148	127 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF19	P17023	458 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	LHCGR	P22888	699 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CRABP1	P29762	137 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MAGEA8	P43361	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	TAS2R40	P59535	323 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	TAP2	Q03519	686 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	GBE1	Q04446	702 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RAB12	Q6IQ22	244 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MYOT	Q9UBF9	498 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874		E7ENX8	843 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PIP5K1C	O60331	668 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	NDUFV2	P19404	249 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ACTB	P60709	375 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	ACTG1	P63261	375 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HHEX	Q03014	270 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	KCNJ8	Q15842	424 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	RDH12	Q96NR8	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	NANOG	Q9H9S0	305 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CHD2-208	ENST00000626874	OR5H15	A6NDH6	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35

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