RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 THBS1P07996 1170 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 UCHL1P09936 223 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 OVGP1Q12889 678 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MANEAQ5SRI9 462 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ARCQ7LC44 396 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 NEURL2Q9BR09 285 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 K7ERU9 68 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 M0R143 59 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PDCD5O14737 125 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A5O76082 557 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GOSR1O95249 250 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NUDT14O95848 222 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 CHRNGP07510 517 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ACTR1BP42025 376 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NRG3P56975 720 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MAMLD1Q13495 774 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 LRRC26Q2I0M4 334 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC36A3Q495N2 470 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC9AQ6UXN8 241 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SNX15Q9NRS6 342 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 THSD1Q9NS62 852 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NCANO14594 1321 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CHD4Q14839 1912 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 METTL15A6NJ78 407 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A12O75746 678 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 GALNSP34059 522 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NSG1P42857 185 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ADGRE1Q14246 886 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PTPRRQ15256 657 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SGCAQ16586 387 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 UPP1Q16831 310 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PXKQ7Z7A4 578 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM19Q9H013 955 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GLRX2Q9NS18 164 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 IMPA2O14732 288 aa6.06□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 ITPKAP23677 461 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FMO4P31512 558 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SDC2P34741 201 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GMPRP36959 345 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 POU3F4P49335 361 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC18A1P54219 525 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 EPHA5P54756 1037 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 BLOC1S1P78537 153 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SERINC3Q13530 473 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SNAPC1Q16533 368 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LPAL2Q16609 132 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa6.06□□□□□ -1.44
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