RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 TRIM8Q9BZR9 551 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 KCNK12Q9HB15 430 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 FZD3Q9NPG1 666 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 GLS2Q9UI32 602 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PLAGL1Q9UM63 463 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SNX13Q9Y5W8 968 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SNX8Q9Y5X2 465 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PIPSLA2A3N6 862 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MAGEB17A8MXT2 336 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ARPC2O15144 300 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SLC31A1O15431 190 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ARHGEF9O43307 516 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DFNA5O60443 496 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRMT3O60678 531 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 UGT2B11O75310 529 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ETHE1O95571 254 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRPS1L1P21108 318 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ALAS2P22557 587 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HTR1EP28566 365 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 S100A3P33764 101 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HTR3AP46098 478 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CLCNKAP51800 687 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CDH15P55291 814 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MTPNP58546 118 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PPP2CBP62714 309 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PPP2CAP67775 309 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PLIN5Q00G26 463 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 TEKQ02763 1124 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DGUOKQ16854 277 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SPIN4Q56A73 249 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 EOGTQ5NDL2 527 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ARMC4Q5T2S8 1044 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ADNP2Q6IQ32 1131 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 NOXA1Q86UR1 476 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 IFNEQ86WN2 208 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 STX12Q86Y82 276 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 KIF18BQ86Y91 864 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 UBQLNLQ8IYU4 475 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 FLCNQ8NFG4 579 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR8K5Q8NH50 307 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MRGPRX1Q96LB2 322 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HHIPQ96QV1 700 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 OR52E6Q96RD3 313 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 APOOQ9BUR5 198 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRO3102Q9H379 93 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 GHITMQ9H3K2 345 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 VAPAQ9P0L0 249 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 PPT2Q9UMR5 302 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 NUMA1Q14980 2115 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 A0A096LPI6 279 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 DHRS12A0PJE2 317 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 F8W036 122 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 ERN1O75460 977 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 SNX4O95219 450 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 LRATO95237 230 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-204ENST00000546621 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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