RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MPZL2O60487 215 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CLDN11O75508 207 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SLC22A5O76082 557 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 OAZ2O95190 189 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PRKAR1AP10644 381 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SOAT1P35610 550 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ALDH9A1P49189 494 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SLC11A2P49281 568 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CLDN20P56880 219 aa16.99■□□□□ 0.31
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PREB-208ENST00000468045 CASP12Q6UXS9 341 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MMP21Q8N119 569 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PLXNA3P51805 1871 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 TMEM88BA6NKF7 163 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CASKO14936 926 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ACADMP11310 421 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 GSTM5P46439 218 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 XKP51811 444 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa16.99■□□□□ 0.31
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PREB-208ENST00000468045 FCRL1Q96LA6 429 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 BTNL2Q9UIR0 455 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.99■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SHISA3A0PJX4 238 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 DVL2O14641 736 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 VNN2O95498 520 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 INPP1P49441 399 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 OR11H4Q8NGC9 324 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 RETREG1Q9H6L5 497 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SGK2Q9HBY8 427 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CD84Q9UIB8 345 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 LANCL1O43813 399 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SSTR2P30874 369 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CSNK1DP48730 415 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PER3P56645 1201 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 BCL2L1Q07817 233 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MGAT3Q09327 533 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 HSDL2Q6YN16 418 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 DUSP18Q8NEJ0 188 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ZNF680Q8NEM1 530 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 WFDC5Q8TCV5 224 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ASB11Q8WXH4 323 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PRRG1O14668 218 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ZNF623O75123 536 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PAHP00439 452 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 OSMP13725 252 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 HMGA2P52926 109 aa16.98■□□□□ 0.31
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PREB-208ENST00000468045 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 CCL15Q16663 113 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MPEG1Q2M385 716 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 SLC51BQ86UW2 128 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 LAPTM4BQ86VI4 370 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ACAT2Q9BWD1 397 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ZNF222Q9UK12 451 aa16.98■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 TRAV6A0A075B6T7 132 aa16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 A0A0A6YYJ9 748 aa16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 PRMT3O60678 531 aa16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 IFNW1P05000 195 aa16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.313e-8■■■□□ 18
PREB-208ENST00000468045 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
PREB-208ENST00000468045 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa16.97■□□□□ 0.31
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