RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd22Q9D3J5 191 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrilQ9DBY4 809 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Isca2Q9DCB8 154 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adrm1Q9JKV1 407 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CenphQ9QYM8 241 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Actr10Q9QZB7 417 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Skp1Q9WTX5 163 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ClcnkbQ9WUB6 687 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Med13lQ6JPI3 2207 aa10.48□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc28Q80XJ3 2450 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrna10B2RX82 447 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lilra5D3Z7A9 295 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8159E9Q0R1 267 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RbpjlO08674 515 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agtr2P35374 363 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EpxP49290 716 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh5P55284 784 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl21aP84444 133 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl21bP86792 133 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccl21cP86793 133 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdr2P97817 455 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wfdc6aQ3UW55 136 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf583Q3V080 568 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trp53i11Q4QQM4 189 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GcdhQ60759 438 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eps15l1Q60902 907 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly6eQ64253 130 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lilrb4Q64281 335 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr871Q7TRF0 311 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wipi2Q80W47 445 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q80WR5 230 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AftphQ80WT5 931 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Enoph1Q8BGB7 257 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atl1Q8BH66 558 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hcar1Q8C131 343 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec2hQ8C1T8 218 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Akr7a2Q8CG76 367 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc16a14Q8K1C7 512 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nectin4Q8R007 508 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl25Q8R2P1 589 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HpgdQ8VCC1 269 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Calhm2Q8VEC4 323 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1443Q8VFW8 312 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sec16bQ91XT4 1051 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AadacQ99PG0 398 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tubb4aQ9D6F9 444 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lypd6bQ9D7F2 191 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kctd4Q9D7X1 259 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpn1Q9JJN5 457 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PigqQ9QYT7 581 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo1cQ9WTI7 1063 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtgfrnQ9WV91 879 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zscan12Q9Z1D7 501 aa10.47□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A1L1SR50 188 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 2010106E10RikA2ANY3 279 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr155A2AWR3 868 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DytnA2CI98 653 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr608E9Q564 316 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc9a3G3X939 829 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stxbp1O08599 594 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3yl1O08641 340 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Capn1O35350 713 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clk4O35493 481 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Emp3O35912 163 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctnnd2O35927 1247 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PspnO70300 156 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NgfP01139 241 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tuba3aP05214 450 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alas2P08680 587 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cox5bP19536 128 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CblP22682 913 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GrnP28798 589 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ArsaP50428 506 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Jak1P52332 1153 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nanos3P60324 178 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc30a3P97441 388 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prrx2Q06348 247 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4galnt2Q09199 510 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lemd1Q14C37 129 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Defb41Q30KP6 65 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem173Q3TBT3 378 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MertkQ60805 994 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nsg1Q62092 185 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rexo4Q6PAQ4 432 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptx4Q6RUU0 478 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a40Q8BGP6 337 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pithd1Q8BWR2 211 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc22Q8C159 568 aa10.46□□□□□ -0.73
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8K039 155 aa10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.6 ms