Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,3■■■■□ 3,24
Trp53i11Q4QQM4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Trp53i11Q4QQM4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Trp53i11Q4QQM4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Trp53i11Q4QQM4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Trp53i11Q4QQM4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Trp53i11Q4QQM4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,12■■■□□ 2,57
Trp53i11Q4QQM4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Trp53i11Q4QQM4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,38■■■□□ 2,45
Trp53i11Q4QQM4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Trp53i11Q4QQM4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Trp53i11Q4QQM4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Trp53i11Q4QQM4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,76■■■□□ 2,35
Trp53i11Q4QQM4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Trp53i11Q4QQM4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Trp53i11Q4QQM4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,58■■■□□ 2,33
Trp53i11Q4QQM4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Trp53i11Q4QQM4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Trp53i11Q4QQM4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Trp53i11Q4QQM4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Trp53i11Q4QQM4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Trp53i11Q4QQM4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Trp53i11Q4QQM4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Trp53i11Q4QQM4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Trp53i11Q4QQM4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Trp53i11Q4QQM4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Trp53i11Q4QQM4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Trp53i11Q4QQM4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Trp53i11Q4QQM4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Trp53i11Q4QQM4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Trp53i11Q4QQM4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Trp53i11Q4QQM4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Trp53i11Q4QQM4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Trp53i11Q4QQM4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Trp53i11Q4QQM4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Trp53i11Q4QQM4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Trp53i11Q4QQM4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Trp53i11Q4QQM4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Trp53i11Q4QQM4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Trp53i11Q4QQM4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Trp53i11Q4QQM4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Trp53i11Q4QQM4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trp53i11Q4QQM4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trp53i11Q4QQM4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Trp53i11Q4QQM4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Trp53i11Q4QQM4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Trp53i11Q4QQM4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Trp53i11Q4QQM4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,64■■■□□ 2,01
Trp53i11Q4QQM4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trp53i11Q4QQM4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Trp53i11Q4QQM4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trp53i11Q4QQM4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Trp53i11Q4QQM4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Trp53i11Q4QQM4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,43■■□□□ 1,98
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Trp53i11Q4QQM4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Trp53i11Q4QQM4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Trp53i11Q4QQM4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Trp53i11Q4QQM4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Trp53i11Q4QQM4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Trp53i11Q4QQM4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Trp53i11Q4QQM4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Trp53i11Q4QQM4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Trp53i11Q4QQM4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Trp53i11Q4QQM4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Trp53i11Q4QQM4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Trp53i11Q4QQM4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Trp53i11Q4QQM4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Trp53i11Q4QQM4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Trp53i11Q4QQM4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Trp53i11Q4QQM4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Trp53i11Q4QQM4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Trp53i11Q4QQM4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Trp53i11Q4QQM4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Trp53i11Q4QQM4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Trp53i11Q4QQM4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Trp53i11Q4QQM4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Trp53i11Q4QQM4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Trp53i11Q4QQM4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Trp53i11Q4QQM4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Trp53i11Q4QQM4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Trp53i11Q4QQM4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Trp53i11Q4QQM4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Trp53i11Q4QQM4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Trp53i11Q4QQM4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Trp53i11Q4QQM4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Trp53i11Q4QQM4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Trp53i11Q4QQM4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Trp53i11Q4QQM4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
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