RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 POU6F1Q14863 301 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HERC3Q15034 1050 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 STX1AQ16623 288 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LINC00523Q86TU6 105 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.31□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 FBXW8Q8N3Y1 598 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LIX1Q8N485 282 aa7.31□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ELP5Q8TE02 316 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ASB15Q8WXK1 588 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ARNT2Q9HBZ2 717 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.31□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 A0A087X0T9 212 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 H7BY64 318 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SGK494L7N484 410 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HCN1O60741 890 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CATP04040 527 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FAM228BP0C875 321 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PRKCAP17252 672 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CD53P19397 219 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PSMB4P28070 264 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 EFNA3P52797 238 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SORDQ00796 357 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ICE2Q659A1 982 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MFSD7Q6UXD7 560 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TRILQ7L0X0 811 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 LRRC6Q86X45 466 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PSD4Q8NDX1 1056 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 NUP43Q8NFH3 380 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR4L1Q8NH43 312 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PEX11GQ96HA9 241 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 DACH2Q96NX9 599 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR2A5Q96R48 311 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CCL19Q99731 98 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FAM173AQ9BQD7 235 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PCBD2Q9H0N5 130 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TAC3Q9UHF0 121 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 MAPRE3Q9UPY8 281 aa7.3□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 AHRRA9YTQ3 701 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 C22orf46C9J442 243 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 H3BMM5 538 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CLDN4O14493 209 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PSTPIP1O43586 416 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 OR1I1O60431 355 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 NDUFS3O75489 264 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ITGA10O75578 1167 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ATP6AP2O75787 350 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 ZFAND5O76080 213 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 P04436 131 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 FHP07954 510 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 PRSS56P0CW18 603 aa7.29□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 IL1RNP18510 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CHRM3P20309 590 aa7.29□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 OPRM1P35372 400 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 CDKN2BP42772 138 aa7.29□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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CASP4-201ENST00000393150 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 EMC4Q5J8M3 183 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.29□□□□□ -1.24
CASP4-201ENST00000393150 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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