RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 BSGP35613 385 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B3P37058 310 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARFIP1P53367 373 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R50P59544 299 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEP1AQ16819 746 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRG2Q64ET8 278 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGI4Q8N135 537 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A8Q8N695 610 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 APCDD1LQ8NCL9 501 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 B3GNT7Q8NFL0 401 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRG2BQ96QU4 278 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPCSQ9HAB8 311 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAP2Q9NPF8 381 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSD3Q9NYI0 1048 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMCNQ9ULC0 261 aa18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A6YYD5 115 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM23A6NLE4 172 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTCP00480 354 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPN2P22792 545 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLAMF1Q13291 335 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASA2Q15283 850 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR6A1Q15406 480 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC50Q53HI1 259 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF225Q9UK10 706 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPACA6W5XKT8 324 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 SVILO95425 2214 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLACEA4D250 179 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 LDB3O75112 727 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLRA3O75311 464 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEMA3DO95025 777 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ST13P50502 369 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR143P51810 404 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF17Q02223 184 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLCQ05315 142 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA3CQ13748 450 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT13Q86X67 352 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRHL3Q8TE85 626 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINI1Q99574 410 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABI3Q9P2A4 366 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCDC2Q9UHG0 476 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG4BQ9Y4P1 393 aa18.26■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 HECTD1Q9ULT8 2610 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRR3A8MPY1 467 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMPRSS11DO60235 418 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF2O60811 474 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUPT7LO94864 414 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT15P19012 456 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRKAA2P54646 552 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ID2Q02363 134 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX4Q12846 297 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT88Q13099 833 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 INAQ16352 499 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR180Q86V85 440 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARMC10Q8N2F6 343 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 MDS2Q8NDY4 140 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCLNQ969V3 563 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAAR6Q96RI8 345 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.25■□□□□ 0.51
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDCP1Q9H5V8 836 aa18.25■□□□□ 0.51
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