RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 PAGE2Q7Z2X7 111 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR155Q7Z3F1 870 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM46Q7Z4K8 759 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LANCL2Q9NS86 450 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM29Q9UKF5 820 aa31.22■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP8B1O43520 1251 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITM2AO43736 263 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC1A6P48664 564 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX3Q13277 289 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLAMF1Q13291 335 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF165Q6ZSG1 346 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCMF1Q9P0J7 381 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa31.21■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA1BQ00975 2339 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0A6YYD5 115 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDH17O14917 1159 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEDO75530 441 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHN1P15882 459 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP2R2AP63151 447 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGCS1Q01581 520 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRGPREQ86SM8 312 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIM42Q8IWZ5 723 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGR3Q8TD06 166 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPACA6W5XKT8 324 aa31.2■■■□□ 2.59
CTDNEP1-209ENST00000574205 BST1Q10588 318 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMPG1Q17R60 797 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP20A1Q6UW02 462 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 COMMD6Q7Z4G1 85 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 C20orf27Q9GZN8 174 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MS4A12Q9NXJ0 267 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM233B4DJY2 109 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4GALT2O60909 372 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFNA3P52797 238 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT3A2Q3SY77 523 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHTF18Q8WVB6 975 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF11Q9UIL8 331 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 FBXW2Q9UKT8 454 aa31.19■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM227AF5H4B4 570 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYR61O00622 381 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALOX12BO75342 701 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHAGQ02094 409 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPIN4Q56A73 249 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 QSOX2Q6ZRP7 698 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM47BQ8NA70 645 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLPP5Q8NEB5 264 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TWIST2Q8WVJ9 160 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS50Q96JG6 964 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAP2CQ9Y3L5 183 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITPR1Q14643 2758 aa31.18■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SOCS6O14544 535 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS11DO60235 418 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK1P06870 262 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf89P0DMQ9 161 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB109BQ30KR1 87 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATG16L1Q676U5 607 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR180Q86V85 440 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF595Q8IYB9 648 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIRREL3Q8IZU9 778 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL21AQ8WXB1 218 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSF3RQ99062 836 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SORT1Q99523 831 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBB1Q9H4B7 451 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MANSC1Q9H8J5 431 aa31.17■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP10A1A4S6 786 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2W5A6NFC9 320 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEX12O00623 359 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN4O14493 209 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRMT3O60678 531 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBAP04062 536 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGB2P05107 769 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM58BPP0C7Q3 252 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP1A4Q13733 1029 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM205Q6UW68 189 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIRREL2Q6UWL6 708 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFCAB3Q8N7B9 438 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF781Q8N8C0 355 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 P4HTMQ9NXG6 502 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAO1Q9UJM8 370 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMACHCQ9Y4U1 282 aa31.16■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC28A1O00337 649 aa31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPN2P22792 545 aa31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms