RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516665.1

RNU6-539P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 539, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-539P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-539P-201ENST00000516665 H3BQ06 376 aaPredicted RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 SAP30O75446 220 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 NKX2-2O95096 273 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 P4HA1P13674 534 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 G6PCP35575 357 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 CSNK1DP48730 415 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 NEK2P51955 445 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PEX3P56589 373 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 TIMM10P62072 90 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 BTG1P62324 171 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 DOC2AQ14183 400 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 GALEQ14376 348 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 CNPY1Q3B7I2 92 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 SPANXN4Q5MJ08 99 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ELFN2Q5R3F8 820 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 SHEQ5VZ18 495 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 NANOGP8Q6NSW7 305 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PPP4R4Q6NUP7 873 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 GALNT5Q7Z7M9 940 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ZNF781Q8N8C0 355 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 AFG1LQ8WV93 481 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 BRI3BPQ8WY22 251 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PIK3R3Q92569 461 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 GOLGA1Q92805 767 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ELP4Q96EB1 424 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ANKRD27Q96NW4 1050 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 TLE6Q9H808 572 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 STARD7Q9NQZ5 370 aa-1.63□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 HERC1Q15751 4861 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 MACROD2A1Z1Q3 448 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PLEKHD1A6NEE1 506 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 C2CD4DB7Z1M9 353 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ALG1L2C9J202 215 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 HAS3O00219 553 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 O00370 1275 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PEX12O00623 359 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 LDLRAD4O15165 306 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PMM2O15305 246 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 SIGLEC5O15389 551 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ANP32CO43423 234 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 POLR2MP0CAP2 368 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 XCR1P46094 333 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 MCM2P49736 904 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PRKAA2P54646 552 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 MTTPP55157 894 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 ZNF235Q14590 738 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 FAM209BQ5JX69 171 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 SUSD4Q5VX71 490 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 RNF165Q6ZSG1 346 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PRSS41Q7RTY9 318 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 RILPL2Q969X0 211 aa-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 Q9H3A6 140 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ZHX3Q9H4I2 956 aa-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 GMEB2Q9UKD1 530 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 MAU2Q9Y6X3 613 aa-1.64□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 IGSF1Q8N6C5 1336 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-539P-201ENST00000516665 TBX19O60806 448 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 PDGFRAP16234 1089 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 NMBRP28336 390 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 HOXA9P31269 272 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 HADHAP40939 763 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 TAS2R40P59535 323 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 NOP14P78316 857 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 MGAT3Q09327 533 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 STK11Q15831 433 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 CA9Q16790 459 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 CMPK2Q5EBM0 449 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-539P-201ENST00000516665 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
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