RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scgb2b17S4R2V3 82 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pramef20B1ARV6 477 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6685D3YYP3 228 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm8897L7N294 181 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gcm2O09102 504 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clk3O35492 638 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psmb10O35955 273 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp8b1O88962 500 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcmt1P23506 227 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nat3P50296 290 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tm9sf2P58021 662 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smim24Q0VG18 120 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MagixQ4KL35 324 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Satb1Q60611 764 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zp1Q62005 623 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gramd2bQ6PEM6 445 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HjurpQ6PG16 667 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prr5Q812A5 387 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hus1Q8BQY8 280 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IlvblQ8BU33 632 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700020N01RikQ8CF20 87 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam129bQ8R1F1 749 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Retreg1dQ8VE91 480 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps4aQ8VEJ9 437 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr575Q8VH16 318 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hdac8Q8VH37 377 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec16bQ91XT4 1051 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mto1Q923Z3 669 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Asf1aQ9CQE6 204 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 5330417H12RikQ9D3P2 110 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmigd1Q9D7L8 261 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pnp2Q9D8C9 305 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AgtrapQ9WVK0 161 aa9.8□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cytl1A1E5L0 139 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp809G3X9G7 402 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H2-M9O19442 342 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MbP04247 154 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BrafP28028 804 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gdi1P50396 447 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SgcgP82348 291 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Yy2Q3TTC2 378 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdh12Q5RJH3 794 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1418Q7TQS3 318 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf410Q8BKX7 478 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdt1Q8R4E9 557 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf8Q8VC56 488 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1391Q8VFA4 311 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arrb2Q91YI4 410 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scpep1Q920A5 452 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr146Q99LE2 333 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OoepQ9CWE6 164 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aldh6a1Q9EQ20 535 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arpc3Q9JM76 178 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 UxtQ9WTZ0 157 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bcl10Q9Z0H7 233 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Upk1bQ9Z2C6 260 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cfap77A0A087WRI3 283 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5938A2AEN9 163 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TriqkB2B9E1 86 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5475D3YV11 175 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm6811E9Q3Y8 510 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm14139F6ZS36 494 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r168K7N6B6 309 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mtnd4P03911 459 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gria1P23818 907 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nedd8P29595 81 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gabarapl2P60521 117 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fads2p1Q0VAX3 487 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hist2h2acQ64523 129 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1045Q7TR80 315 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sall4Q8BX22 1067 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ExogQ8C163 368 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf222Q8CEF8 211 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dcun1d3Q8K0V2 304 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sirt4Q8R216 333 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr729Q8VET4 323 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r69Q8VIC1 319 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhb21Q91V48 774 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fitm1Q91V79 292 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr459Q924H8 314 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9D1K7 174 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AgkQ9ESW4 421 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Panx1Q9JIP4 426 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Thap11Q9JJD0 305 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TrioQ0KL02 3102 aa9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13420A0A140LJJ2 248 aa9.78□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam34A2RSG8 714 aa9.78□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm19965J3QNY8 723 aa9.78□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rhox2hK7N6P1 191 aa9.78□□□□□ -0.84
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr237-ps1K9J725 310 aa9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.8 ms