Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Gm19965J3QNY8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gm19965J3QNY8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Gm19965J3QNY8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gm19965J3QNY8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Gm19965J3QNY8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Gm19965J3QNY8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gm19965J3QNY8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gm19965J3QNY8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Gm19965J3QNY8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm19965J3QNY8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gm19965J3QNY8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gm19965J3QNY8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm19965J3QNY8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm19965J3QNY8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm19965J3QNY8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm19965J3QNY8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm19965J3QNY8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Gm19965J3QNY8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Gm19965J3QNY8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gm19965J3QNY8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gm19965J3QNY8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gm19965J3QNY8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gm19965J3QNY8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gm19965J3QNY8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gm19965J3QNY8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gm19965J3QNY8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gm19965J3QNY8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm19965J3QNY8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gm19965J3QNY8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gm19965J3QNY8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Gm19965J3QNY8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm19965J3QNY8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gm19965J3QNY8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gm19965J3QNY8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm19965J3QNY8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gm19965J3QNY8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm19965J3QNY8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm19965J3QNY8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gm19965J3QNY8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm19965J3QNY8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm19965J3QNY8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm19965J3QNY8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm19965J3QNY8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm19965J3QNY8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm19965J3QNY8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm19965J3QNY8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm19965J3QNY8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm19965J3QNY8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm19965J3QNY8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm19965J3QNY8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gm19965J3QNY8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gm19965J3QNY8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm19965J3QNY8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm19965J3QNY8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gm19965J3QNY8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gm19965J3QNY8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm19965J3QNY8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm19965J3QNY8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gm19965J3QNY8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gm19965J3QNY8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gm19965J3QNY8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm19965J3QNY8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm19965J3QNY8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm19965J3QNY8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm19965J3QNY8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm19965J3QNY8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm19965J3QNY8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gm19965J3QNY8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gm19965J3QNY8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gm19965J3QNY8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gm19965J3QNY8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gm19965J3QNY8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gm19965J3QNY8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gm19965J3QNY8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm19965J3QNY8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gm19965J3QNY8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gm19965J3QNY8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm19965J3QNY8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm19965J3QNY8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gm19965J3QNY8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm19965J3QNY8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm19965J3QNY8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm19965J3QNY8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm19965J3QNY8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm19965J3QNY8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm19965J3QNY8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm19965J3QNY8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm19965J3QNY8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm19965J3QNY8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm19965J3QNY8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm19965J3QNY8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm19965J3QNY8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm19965J3QNY8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm19965J3QNY8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm19965J3QNY8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm19965J3QNY8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm19965J3QNY8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm19965J3QNY8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm19965J3QNY8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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