Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIP4

Panx1, Pannexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Panx1Q9JIP4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Panx1Q9JIP4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Panx1Q9JIP4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Panx1Q9JIP4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Panx1Q9JIP4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Panx1Q9JIP4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Panx1Q9JIP4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Panx1Q9JIP4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Panx1Q9JIP4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Panx1Q9JIP4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Panx1Q9JIP4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Panx1Q9JIP4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Panx1Q9JIP4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Panx1Q9JIP4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Panx1Q9JIP4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Panx1Q9JIP4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Panx1Q9JIP4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Panx1Q9JIP4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Panx1Q9JIP4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Panx1Q9JIP4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Panx1Q9JIP4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Panx1Q9JIP4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Panx1Q9JIP4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Panx1Q9JIP4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Panx1Q9JIP4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Panx1Q9JIP4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Panx1Q9JIP4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Panx1Q9JIP4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Panx1Q9JIP4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Panx1Q9JIP4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Panx1Q9JIP4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Panx1Q9JIP4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Panx1Q9JIP4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Panx1Q9JIP4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Panx1Q9JIP4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Panx1Q9JIP4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Panx1Q9JIP4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Panx1Q9JIP4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Panx1Q9JIP4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Panx1Q9JIP4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Panx1Q9JIP4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Panx1Q9JIP4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Panx1Q9JIP4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Panx1Q9JIP4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Panx1Q9JIP4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Panx1Q9JIP4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Panx1Q9JIP4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Panx1Q9JIP4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Panx1Q9JIP4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Panx1Q9JIP4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Panx1Q9JIP4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Panx1Q9JIP4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Panx1Q9JIP4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Panx1Q9JIP4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Panx1Q9JIP4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Panx1Q9JIP4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Panx1Q9JIP4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Panx1Q9JIP4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Panx1Q9JIP4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Panx1Q9JIP4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Panx1Q9JIP4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Panx1Q9JIP4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Panx1Q9JIP4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Panx1Q9JIP4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Panx1Q9JIP4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Panx1Q9JIP4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Panx1Q9JIP4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Panx1Q9JIP4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Panx1Q9JIP4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Panx1Q9JIP4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Panx1Q9JIP4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Panx1Q9JIP4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Panx1Q9JIP4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Panx1Q9JIP4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Panx1Q9JIP4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Panx1Q9JIP4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Panx1Q9JIP4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Panx1Q9JIP4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Panx1Q9JIP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Panx1Q9JIP4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Panx1Q9JIP4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Panx1Q9JIP4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Panx1Q9JIP4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Panx1Q9JIP4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Panx1Q9JIP4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Panx1Q9JIP4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Panx1Q9JIP4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Panx1Q9JIP4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Panx1Q9JIP4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Panx1Q9JIP4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Panx1Q9JIP4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Panx1Q9JIP4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Panx1Q9JIP4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Panx1Q9JIP4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Panx1Q9JIP4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Panx1Q9JIP4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Panx1Q9JIP4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Panx1Q9JIP4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Panx1Q9JIP4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Panx1Q9JIP4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms