Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Cdh12Q5RJH3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cdh12Q5RJH3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cdh12Q5RJH3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cdh12Q5RJH3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Cdh12Q5RJH3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdh12Q5RJH3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdh12Q5RJH3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdh12Q5RJH3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdh12Q5RJH3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cdh12Q5RJH3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cdh12Q5RJH3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cdh12Q5RJH3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdh12Q5RJH3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdh12Q5RJH3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdh12Q5RJH3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdh12Q5RJH3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdh12Q5RJH3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdh12Q5RJH3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdh12Q5RJH3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdh12Q5RJH3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh12Q5RJH3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdh12Q5RJH3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cdh12Q5RJH3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh12Q5RJH3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdh12Q5RJH3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdh12Q5RJH3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdh12Q5RJH3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh12Q5RJH3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdh12Q5RJH3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh12Q5RJH3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh12Q5RJH3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh12Q5RJH3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdh12Q5RJH3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh12Q5RJH3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdh12Q5RJH3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh12Q5RJH3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh12Q5RJH3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh12Q5RJH3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh12Q5RJH3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cdh12Q5RJH3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cdh12Q5RJH3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh12Q5RJH3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh12Q5RJH3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh12Q5RJH3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh12Q5RJH3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdh12Q5RJH3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh12Q5RJH3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdh12Q5RJH3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh12Q5RJH3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdh12Q5RJH3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdh12Q5RJH3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdh12Q5RJH3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdh12Q5RJH3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdh12Q5RJH3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdh12Q5RJH3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdh12Q5RJH3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdh12Q5RJH3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh12Q5RJH3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh12Q5RJH3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh12Q5RJH3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdh12Q5RJH3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh12Q5RJH3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdh12Q5RJH3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdh12Q5RJH3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh12Q5RJH3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdh12Q5RJH3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdh12Q5RJH3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdh12Q5RJH3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdh12Q5RJH3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh12Q5RJH3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdh12Q5RJH3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdh12Q5RJH3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cdh12Q5RJH3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh12Q5RJH3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh12Q5RJH3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdh12Q5RJH3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cdh12Q5RJH3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh12Q5RJH3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh12Q5RJH3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh12Q5RJH3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cdh12Q5RJH3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cdh12Q5RJH3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdh12Q5RJH3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cdh12Q5RJH3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdh12Q5RJH3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdh12Q5RJH3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh12Q5RJH3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh12Q5RJH3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh12Q5RJH3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdh12Q5RJH3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdh12Q5RJH3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdh12Q5RJH3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdh12Q5RJH3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms