Protein–RNA interactions for Protein: Q64523

Hist2h2ac, Histone H2A type 2-C, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2acQ64523 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35,16■■■■□ 3,22
Hist2h2acQ64523 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,79■■■□□ 2,84
Hist2h2acQ64523 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Hist2h2acQ64523 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Hist2h2acQ64523 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Hist2h2acQ64523 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Hist2h2acQ64523 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31,26■■■□□ 2,59
Hist2h2acQ64523 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Hist2h2acQ64523 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,59■■■□□ 2,49
Hist2h2acQ64523 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Hist2h2acQ64523 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Hist2h2acQ64523 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Hist2h2acQ64523 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Hist2h2acQ64523 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Hist2h2acQ64523 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Hist2h2acQ64523 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Hist2h2acQ64523 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Hist2h2acQ64523 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Hist2h2acQ64523 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Hist2h2acQ64523 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Hist2h2acQ64523 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Hist2h2acQ64523 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Hist2h2acQ64523 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Hist2h2acQ64523 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Hist2h2acQ64523 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Hist2h2acQ64523 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Hist2h2acQ64523 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Hist2h2acQ64523 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Hist2h2acQ64523 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Hist2h2acQ64523 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Hist2h2acQ64523 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Hist2h2acQ64523 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Hist2h2acQ64523 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Hist2h2acQ64523 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Hist2h2acQ64523 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Hist2h2acQ64523 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Hist2h2acQ64523 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Hist2h2acQ64523 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Hist2h2acQ64523 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Hist2h2acQ64523 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Hist2h2acQ64523 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Hist2h2acQ64523 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Hist2h2acQ64523 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,14■■■□□ 2,1
Hist2h2acQ64523 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Hist2h2acQ64523 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Hist2h2acQ64523 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Hist2h2acQ64523 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Hist2h2acQ64523 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Hist2h2acQ64523 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Hist2h2acQ64523 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Hist2h2acQ64523 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Hist2h2acQ64523 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Hist2h2acQ64523 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hist2h2acQ64523 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Hist2h2acQ64523 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Hist2h2acQ64523 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Hist2h2acQ64523 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Hist2h2acQ64523 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Hist2h2acQ64523 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Hist2h2acQ64523 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,56■■■□□ 2
Hist2h2acQ64523 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Hist2h2acQ64523 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Hist2h2acQ64523 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Hist2h2acQ64523 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,47■■□□□ 1,99
Hist2h2acQ64523 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,99
Hist2h2acQ64523 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Hist2h2acQ64523 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Hist2h2acQ64523 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Hist2h2acQ64523 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Hist2h2acQ64523 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Hist2h2acQ64523 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Hist2h2acQ64523 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hist2h2acQ64523 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Hist2h2acQ64523 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hist2h2acQ64523 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hist2h2acQ64523 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hist2h2acQ64523 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hist2h2acQ64523 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hist2h2acQ64523 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Hist2h2acQ64523 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Hist2h2acQ64523 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Hist2h2acQ64523 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Hist2h2acQ64523 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Hist2h2acQ64523 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Hist2h2acQ64523 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Hist2h2acQ64523 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Hist2h2acQ64523 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Hist2h2acQ64523 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Hist2h2acQ64523 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Hist2h2acQ64523 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms