RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6811E9Q3Y8 510 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm6337K7N6X9 211 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3115L7N285 211 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3488M0QW81 238 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdh2P15116 906 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Apex1P28352 317 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rph3aP47708 681 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PdxpP60487 292 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fads2p1Q0VAX3 487 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acsm3Q3UNX5 580 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zc3h12aQ5D1E7 596 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cxcl17Q5UW37 119 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dennd5aQ6PAL8 1287 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olig3Q6PFG8 273 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1045Q7TR80 315 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpr171Q8BG55 319 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxl4Q8BH70 621 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lacc1Q8BZT9 430 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc187Q8C5V8 958 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Map3k21Q8VDG6 1002 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr729Q8VET4 323 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem168Q91VX9 697 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sfxn1Q99JR1 322 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pole4Q9CQ36 118 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trappc5Q9CQA1 188 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spata1Q9D5R4 444 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1508Q9R0K4 310 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-BlV9GXR0 257 aa20.23■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700014D04RikJ3QMS2 983 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hax1O35387 280 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adrb1P34971 466 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NrtnP97463 195 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pin1rt1Q3ULQ2 159 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf43Q5NCP0 784 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CebpeQ6PZD9 281 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pex26Q8BGI5 305 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q8BGK9 164 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tigd4Q8BUZ3 513 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bbs4Q8C1Z7 520 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700020N01RikQ8CF20 87 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam161aQ8QZV6 448 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r201Q8R262 300 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1276Q8VF40 312 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifitm3Q9CQW9 137 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2610042L04RikQ9D073 150 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 D10Jhu81eQ9D172 266 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SpaarA0A1B0GSZ0 75 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rad21l1A2AU37 552 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgbd1E9Q492 415 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nid1P10493 1245 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr1bP28334 386 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Faf1P54731 649 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adra1aP97718 466 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MitfQ08874 526 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpat2Q14DK4 801 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcna7Q17ST2 489 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EndouQ3V188 412 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc16a12Q8BGC3 486 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pomt2Q8BGQ4 820 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Scn3bQ8BHK2 215 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pbdc1Q9D0B6 198 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Agpat5Q9D1E8 365 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Creb3l4Q9D2A5 370 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rhox2aQ9D4Y3 191 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Panx1Q9JIP4 426 aa20.22■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8267E9Q207 261 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mknk1O08605 427 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Suv39h1O54864 412 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GypaP14220 168 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RxrgP28705 463 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grin2cQ01098 1239 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cpxcr1Q3V0P1 322 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prr14Q7TPN9 612 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acat2Q8CAY6 397 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mill2Q8HWE5 355 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ahi1Q8K3E5 1047 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhb21Q91V48 774 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HadhbQ99JY0 475 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rgs18Q99PG4 235 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpinb1aQ9D154 379 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdhhc21Q9D270 265 aa20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ebna1bp2Q9D903 306 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1188A2AV10 312 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm340F6RGI3 1242 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fbxw9F8VPX2 458 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ChadO55226 358 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tulp3O88413 460 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hcn1O88704 910 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb48Q3UW22 87 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PapolgQ6PCL9 739 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HjurpQ6PG16 667 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr1308Q7TQX0 320 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dlgap2Q8BJ42 1059 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec4a3Q8JZX6 237 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 HopxQ8R1H0 73 aa20.2■□□□□ 0.83
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.2 ms