Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Scn3bQ8BHK2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scn3bQ8BHK2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Scn3bQ8BHK2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,83■■■□□ 2,53
Scn3bQ8BHK2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Scn3bQ8BHK2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scn3bQ8BHK2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Scn3bQ8BHK2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Scn3bQ8BHK2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Scn3bQ8BHK2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Scn3bQ8BHK2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Scn3bQ8BHK2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Scn3bQ8BHK2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Scn3bQ8BHK2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Scn3bQ8BHK2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Scn3bQ8BHK2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,26■■■□□ 2,12
Scn3bQ8BHK2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Scn3bQ8BHK2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Scn3bQ8BHK2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Scn3bQ8BHK2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Scn3bQ8BHK2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Scn3bQ8BHK2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Scn3bQ8BHK2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Scn3bQ8BHK2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Scn3bQ8BHK2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Scn3bQ8BHK2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Scn3bQ8BHK2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Scn3bQ8BHK2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Scn3bQ8BHK2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Scn3bQ8BHK2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Scn3bQ8BHK2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Scn3bQ8BHK2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Scn3bQ8BHK2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Scn3bQ8BHK2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Scn3bQ8BHK2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Scn3bQ8BHK2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Scn3bQ8BHK2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Scn3bQ8BHK2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Scn3bQ8BHK2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Scn3bQ8BHK2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Scn3bQ8BHK2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Scn3bQ8BHK2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Scn3bQ8BHK2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Scn3bQ8BHK2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Scn3bQ8BHK2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Scn3bQ8BHK2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Scn3bQ8BHK2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Scn3bQ8BHK2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Scn3bQ8BHK2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Scn3bQ8BHK2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Scn3bQ8BHK2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Scn3bQ8BHK2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Scn3bQ8BHK2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Scn3bQ8BHK2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,84
Scn3bQ8BHK2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Scn3bQ8BHK2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Scn3bQ8BHK2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Scn3bQ8BHK2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Scn3bQ8BHK2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Scn3bQ8BHK2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Scn3bQ8BHK2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Scn3bQ8BHK2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Scn3bQ8BHK2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Scn3bQ8BHK2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Scn3bQ8BHK2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Scn3bQ8BHK2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Scn3bQ8BHK2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Scn3bQ8BHK2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Scn3bQ8BHK2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Scn3bQ8BHK2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Scn3bQ8BHK2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Scn3bQ8BHK2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Scn3bQ8BHK2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Scn3bQ8BHK2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Scn3bQ8BHK2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Scn3bQ8BHK2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Scn3bQ8BHK2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Scn3bQ8BHK2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Scn3bQ8BHK2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Scn3bQ8BHK2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Scn3bQ8BHK2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Scn3bQ8BHK2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Scn3bQ8BHK2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Scn3bQ8BHK2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Scn3bQ8BHK2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Scn3bQ8BHK2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Scn3bQ8BHK2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Scn3bQ8BHK2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Scn3bQ8BHK2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Scn3bQ8BHK2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Scn3bQ8BHK2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Scn3bQ8BHK2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Scn3bQ8BHK2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Scn3bQ8BHK2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Scn3bQ8BHK2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Scn3bQ8BHK2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Scn3bQ8BHK2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Scn3bQ8BHK2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Scn3bQ8BHK2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Scn3bQ8BHK2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms