Protein–RNA interactions for Protein: P15116

Cdh2, Cadherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh2P15116 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cdh2P15116 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdh2P15116 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Cdh2P15116 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cdh2P15116 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Cdh2P15116 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cdh2P15116 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdh2P15116 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cdh2P15116 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdh2P15116 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdh2P15116 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdh2P15116 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh2P15116 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdh2P15116 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdh2P15116 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdh2P15116 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cdh2P15116 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cdh2P15116 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh2P15116 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdh2P15116 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh2P15116 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdh2P15116 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdh2P15116 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdh2P15116 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdh2P15116 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh2P15116 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdh2P15116 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdh2P15116 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh2P15116 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdh2P15116 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh2P15116 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh2P15116 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdh2P15116 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh2P15116 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdh2P15116 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh2P15116 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdh2P15116 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh2P15116 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdh2P15116 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdh2P15116 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdh2P15116 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdh2P15116 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdh2P15116 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdh2P15116 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdh2P15116 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdh2P15116 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdh2P15116 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdh2P15116 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdh2P15116 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdh2P15116 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdh2P15116 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdh2P15116 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdh2P15116 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh2P15116 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cdh2P15116 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cdh2P15116 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdh2P15116 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdh2P15116 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdh2P15116 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdh2P15116 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdh2P15116 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdh2P15116 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cdh2P15116 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cdh2P15116 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdh2P15116 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdh2P15116 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdh2P15116 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh2P15116 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdh2P15116 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdh2P15116 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cdh2P15116 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdh2P15116 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdh2P15116 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdh2P15116 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cdh2P15116 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cdh2P15116 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdh2P15116 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cdh2P15116 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdh2P15116 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cdh2P15116 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdh2P15116 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdh2P15116 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdh2P15116 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdh2P15116 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdh2P15116 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdh2P15116 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdh2P15116 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdh2P15116 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdh2P15116 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdh2P15116 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdh2P15116 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdh2P15116 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdh2P15116 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdh2P15116 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdh2P15116 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh2P15116 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdh2P15116 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdh2P15116 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh2P15116 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdh2P15116 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms