RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF575Q86XF7 245 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 GPC2Q8N158 579 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 KLHDC9Q8NEP7 349 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 LYZL4Q96KX0 146 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 LPAR4Q99677 370 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ASCL2Q99929 193 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SATB2Q9UPW6 733 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ETV7Q9Y603 341 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SMCHD1A6NHR9 2005 aa6.89□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 NDC80O14777 642 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TEX28O15482 410 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CIDEAO60543 219 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 T-ENOLP0DO92 83 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 PAX1P15863 534 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 AMD1P17707 334 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 AKT2P31751 481 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1D2P34982 312 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNK10P57789 538 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 IRX4P78413 519 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CEBPEQ15744 281 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 FCRLAQ7L513 359 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 OR1L3Q8NH93 324 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 C14orf79Q96F83 325 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SIRPDQ9H106 197 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SIX2Q9NPC8 291 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 POLE3Q9NRF9 147 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP57Q9NU63 452 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF186Q9NXI6 227 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.88□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE4BO95155 1302 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 EXTL3O43909 919 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 AKR7A3O95154 331 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ANPEPP15144 967 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC1A3P43003 542 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A12P48065 614 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 GPR50Q13585 617 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CEACAM7Q14002 265 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SPHARQ15513 63 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 LEMD2Q8NC56 503 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TM9SF4Q92544 642 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 GLYATL1Q969I3 302 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 MEIS3Q99687 375 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB17Q9H0T7 212 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.87□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A0U1RRA0 63 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 DENND3A2RUS2 1198 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SERINC4A6NH21 518 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 LRP3O75074 770 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SAP30O75446 220 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 NTN1O95631 604 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 EPOP01588 193 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 EDN1P05305 212 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 SFTPBP07988 381 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ITGA3P26006 1051 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 MAGEA11P43364 429 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TKTL1P51854 596 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 DCDC1P59894 354 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CCZ1BP86790 482 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF74Q16587 644 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 ACCSLQ4AC99 568 aa6.86□□□□□ -1.31
PGGT1B-205ENST00000514178 FGD3Q5JSP0 725 aa6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms