RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa21.11■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 CLEC3AO75596 197 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GSTM2P28161 218 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 HNF4AP41235 474 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 HERC3Q15034 1050 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 GRHL2Q6ISB3 625 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TTLQ8NG68 377 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OR5T3Q8NGG3 340 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SEMA4CQ9C0C4 833 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PLAAQ9Y263 795 aa21.1■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KALRNO60229 2985 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GTL3 188 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PPP6CO00743 305 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 SOCS6O14544 535 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RDH16O75452 317 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 FAM87AP0C7U9 286 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OTX2P32243 289 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 CRHR1P34998 444 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RAB8AP61006 207 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OCA2Q04671 838 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ATP1A4Q13733 1029 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LY6DQ14210 128 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LIPJQ5W064 366 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MRGPREQ86SM8 312 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PRSS58Q8IYP2 241 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 IQCKQ8N0W5 287 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 L3MBTL4Q8NA19 623 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OR7G3Q8NG95 312 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 OR51Q1Q8NH59 317 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MIEF2Q96C03 454 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MS4A6EQ96DS6 147 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RNF11Q9Y3C5 154 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.09■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF860A6NHJ4 632 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ANKDD1BA6NHY2 528 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 G3V2L1 256 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 JRKO75564 520 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 BMP10O95393 424 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PROCP04070 461 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 KRT4P19013 534 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MMP11P24347 488 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 CCR10P46092 362 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 DEFB134Q4QY38 66 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 UNC50Q53HI1 259 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 CPZQ66K79 652 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 TRABD2AQ86V40 505 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RNF175Q8N4F7 328 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 NACC2Q96BF6 587 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 NTMT1Q9BV86 223 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ACSS2Q9NR19 701 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 ZNF225Q9UK10 706 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa21.08■□□□□ 0.97
SYF2-201ENST00000236273 MASP2O00187 686 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 UGDHO60701 494 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 GLRA3O75311 464 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 POLE2P56282 527 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TRAF3Q13114 568 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ZNF678Q5SXM1 525 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 MED27Q6P2C8 311 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 KIRREL2Q6UWL6 708 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ABHD13Q7L211 337 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 UBE3DQ7Z6J8 389 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 RAB43Q86YS6 212 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 QRFPRQ96P65 431 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 CDK15Q96Q40 435 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TMEM237Q96Q45 408 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 SCN2AQ99250 2005 aa21.07■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 ARGFXA6NJG6 315 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 H0YIV9 168 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PLIN3O60664 434 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB5O75953 348 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PIK3CGP48736 1102 aa21.06■□□□□ 0.96
SYF2-201ENST00000236273 PRKAA2P54646 552 aa21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms