RNA–Protein interactions for RNA: YLR298C

YHC1, Transcript of Component of the U1 snRNP complex required for pre-mRNA splicing, yeast

Gene YHC1, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHC1	YLR298C	RER2	P35196	286 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	MCM7	P38132	845 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	SPR28	Q04921	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	GNT1	Q12096	491 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	DCG1	P32460	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	PEP7	P32609	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	SLA2	P33338	968 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	FYV10	P40492	516 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	MND2	P40577	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	HFM1	P51979	1187 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	KIN4	Q01919	800 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	ACM1	Q08981	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHC1	YLR298C	RRT14	P40470	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	CTF4	Q01454	927 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	TPO1	Q07824	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	ATE1	P16639	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	MGE1	P38523	228 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	MSS4	P38994	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	PLB1	P39105	664 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	POL32	P47110	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	RAD53	P22216	821 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	YJR107W	P47145	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	ADY3	Q07732	790 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	XYL2	Q07993	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	PNT1	P38969	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	GEM1	P39722	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	RAD27	P26793	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	SLD2	P34252	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	YPT53	P36019	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	POA1	P38218	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	MET12	P46151	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	MTC3	P53077	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHC1	YLR298C	HIS5	P07172	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	ENA1	P13587	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	DUT1	P33317	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	EXG2	P52911	562 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	LYP1	P32487	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	YAP1801	P38856	637 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	CHA4	P43634	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	IOC3	P43596	787 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	EEB1	Q02891	456 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YHC1	YLR298C	INO1	P11986	533 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	CDA1	Q06702	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	OSW2	Q12202	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	SPE1	P08432	466 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	YKL151C	P36059	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	YGR012W	P53206	393 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	SRP101	P32916	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	MDM38	Q08179	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	AIM39	Q08223	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	PPM2	Q08282	695 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	LAS17	Q12446	633 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	RKM4	Q12504	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHC1	YLR298C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	OAR1	P35731	278 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	MOH1	P38191	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	YGL176C	P46945	554 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	TYW3	P53177	273 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	NPC2	Q12408	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	CDC34	P14682	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	YKL107W	P34251	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	GIC1	P38785	314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	RMD1	Q03441	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	SRT1	Q03175	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	YML122C	Q03207	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	FUN30	P31380	1131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	CCC2	P38995	1004 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	BUL1	P48524	976 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	NCS6	P53088	359 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	ENB1	Q08299	606 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	HSF1	P10961	833 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	PET112	P33893	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	MET10	P39692	1035 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	NPP2	P39997	493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHC1	YLR298C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10 ms