RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	YHL050C	P38721	697 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	YHR219W	P38900	624 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	MXR1	P40029	184 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	ENA2	Q01896	1091 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	YMR206W	Q03695	313 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	MCH5	Q08777	521 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	OXR1	Q08952	273 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	ENA5	Q12691	1091 aa		3.48	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	UGA2	P38067	497 aa		3.47	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	SUL1	P38359	859 aa		3.47	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	IRC10	Q08118	586 aa		3.47	□□□□□ -1.85
BLI1	YKL061W	HXT13	P39924	564 aa		3.46	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	HXT17	P53631	564 aa		3.46	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	SIW14	P53965	281 aa		3.46	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	HXT15	P54854	567 aa		3.46	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	TAF13	P11747	167 aa		3.45	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	PEX2	P32800	271 aa		3.45	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	NPC2	Q12408	173 aa		3.45	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	MPH1	P40562	993 aa		3.44	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	CNN1	P43618	361 aa		3.44	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	MUK1	Q02866	612 aa		3.44	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	MTH1	P35198	433 aa		3.43	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	RRT14	P40470	206 aa		3.43	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	GNP1	P48813	663 aa		3.43	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	ENB1	Q08299	606 aa		3.43	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	KAR4	P25583	335 aa		3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	SEC8	P32855	1065 aa		3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	SLA2	P33338	968 aa		3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	GND2	P53319	492 aa		3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	OMS1	Q06668	471 aa		3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	ACM1	Q08981	209 aa		3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	YER158C	P40095	573 aa		3.41	□□□□□ -1.86
BLI1	YKL061W	SPE1	P08432	466 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	ERG4	P25340	473 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	SPC42	P36094	363 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	MTC3	P53077	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	NCS6	P53088	359 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	YGR012W	P53206	393 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	CDA1	Q06702	301 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	ACF2	Q12168	779 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	NDJ1	Q12366	352 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	TRM13	Q12383	476 aa		3.4	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	SRP101	P32916	621 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	KTR4	P38131	464 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	ENT3	P47160	408 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	MRL1	Q06815	381 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	WHI5	Q12416	295 aa		3.39	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	MDM10	P18409	493 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	MCM7	P38132	845 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	YAP1801	P38856	637 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	GEM1	P39722	662 aa		3.38	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	MRPS18	P42847	217 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	GNT1	Q12096	491 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	MCD1	Q12158	566 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	OSW2	Q12202	724 aa		3.37	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	GCR1	P07261	785 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	PPX1	P38698	397 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	TIM44	Q01852	431 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	AFT2	Q08957	416 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	BNR1	P40450	1375 aa		3.36	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	PNT1	P38969	423 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	THI12	P42883	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	THI5	P43534	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	THI11	P47183	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	THI13	Q07748	340 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	SUT2	Q12286	268 aa		3.35	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	RER2	P35196	286 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	CCC2	P38995	1004 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	YGR122W	P53272	402 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	RNT1	Q02555	471 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	RLF2	Q12495	606 aa		3.34	□□□□□ -1.87
BLI1	YKL061W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	ALG7	P07286	448 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	YAP7	Q08182	245 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	GUP2	Q08929	609 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
BLI1	YKL061W	RAD2	P07276	1031 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	YKL151C	P36059	337 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	SDS3	P40505	327 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	HSF1	P10961	833 aa		3.31	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
BLI1	YKL061W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88

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